90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2893 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2893  NADH dehydrogenase  100 
 
 
160 aa  328  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0562  NADH dehydrogenase  92.5 
 
 
160 aa  308  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000829032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0691  hypothetical protein  79.75 
 
 
159 aa  271  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0875  NADH dehydrogenase  79.11 
 
 
159 aa  270  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000403933 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0743  hypothetical protein  79.11 
 
 
159 aa  270  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0691  hypothetical protein  79.11 
 
 
159 aa  270  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00544523  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0677  hypothetical protein  79.11 
 
 
159 aa  270  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4501  rhodanese domain family protein  79.11 
 
 
159 aa  270  6e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000066362 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0943  NADH dehydrogenase  79.11 
 
 
159 aa  270  6e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000101023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0835  NADH dehydrogenase  79.11 
 
 
159 aa  270  6e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00145998  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0871  hypothetical protein  78.48 
 
 
159 aa  269  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.92 
 
 
817 aa  190  9e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.55 
 
 
831 aa  182  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.72 
 
 
864 aa  176  9e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.41 
 
 
817 aa  166  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  52.94 
 
 
820 aa  166  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.38 
 
 
837 aa  164  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  50 
 
 
356 aa  160  9e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  52.26 
 
 
354 aa  160  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  52.26 
 
 
354 aa  160  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.35 
 
 
813 aa  159  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0814  hypothetical protein  46.79 
 
 
196 aa  157  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.15 
 
 
834 aa  157  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1185  hypothetical protein  44.87 
 
 
192 aa  154  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.491301  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  46.5 
 
 
938 aa  152  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  48.37 
 
 
354 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  48.37 
 
 
354 aa  149  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  48.37 
 
 
354 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1150  hypothetical protein  44.87 
 
 
191 aa  147  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000124979  decreased coverage  0.000000301947 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0437  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  44.87 
 
 
158 aa  144  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2425  hypothetical protein  42.31 
 
 
159 aa  130  9e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0812  hypothetical protein  37.5 
 
 
201 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0647  hypothetical protein  41.77 
 
 
158 aa  124  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20020  hypothetical protein  40.38 
 
 
158 aa  122  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000359869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1738  hypothetical protein  40.25 
 
 
139 aa  105  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2931  putative NADH dehydrogenase  36.54 
 
 
166 aa  103  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0976  putative NADH dehydrogenase  34.87 
 
 
163 aa  103  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.37557  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0031  hypothetical protein  35.15 
 
 
169 aa  97.8  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000221456  normal  0.0655494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1710  SirA family protein  31.87 
 
 
560 aa  95.5  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0499089 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0123  hypothetical protein  35.15 
 
 
169 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2326  hypothetical protein  34.55 
 
 
169 aa  94.7  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.3184  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1961  hypothetical protein  33.94 
 
 
169 aa  94  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000557384  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0059  hypothetical protein  32.35 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0037  hypothetical protein  32.35 
 
 
170 aa  92  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.151182  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0039  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  90.5  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000944942  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  35.71 
 
 
131 aa  89.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0575  hypothetical protein  32.54 
 
 
169 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000240912  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1840  hypothetical protein  30.59 
 
 
170 aa  87.4  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.381099  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0090  hypothetical protein  37.41 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.63908  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2097  conserved hypothetical protein  36.25 
 
 
143 aa  85.1  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2420  hypothetical protein  33.96 
 
 
195 aa  83.6  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3384  hypothetical protein  32.05 
 
 
190 aa  82  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3700  hypothetical protein  30.57 
 
 
197 aa  82  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.188132  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4318  conserved hypothetical protein-like protein  31.21 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.559557  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3727  hypothetical protein  30.19 
 
 
210 aa  80.5  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239652  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0964  hypothetical protein  30.23 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2499  hypothetical protein  31.4 
 
 
181 aa  79  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.638714  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1454  hypothetical protein  34.16 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0996  hypothetical protein  33.12 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.377605  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1084  hypothetical protein  33.54 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0986  hypothetical protein  31.01 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163043  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3745  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0481362  hitchhiker  0.0000104136 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2186  hypothetical protein  32.69 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0361535  hitchhiker  0.0000000354849 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2556  hypothetical protein  32.69 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177725  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1549  hypothetical protein  34.78 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0341965 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  33.97 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0891  hypothetical protein  33.12 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000165233  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0555  DsrE family protein  35.26 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0210711  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2495  hypothetical protein  31.33 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2876  hypothetical protein  31.33 
 
 
207 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00403989  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1242  hypothetical protein  31.33 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0793  hypothetical protein  30.43 
 
 
200 aa  67.8  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045266  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.17 
 
 
138 aa  67  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0776  hypothetical protein  32.91 
 
 
156 aa  61.6  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0401032  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1253  hypothetical protein  29.63 
 
 
203 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0852  hypothetical protein  27.86 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000244702  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2562  hypothetical protein  29.03 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000530705  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1612  hypothetical protein  28.39 
 
 
170 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4616  hypothetical protein  27.74 
 
 
170 aa  55.1  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.379533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3038  hypothetical protein  27.74 
 
 
169 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0116175  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0167  peroxiredoxin family protein  33.33 
 
 
137 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2645  hypothetical protein  33.12 
 
 
155 aa  54.3  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0484  hypothetical protein  31.01 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0107148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0352  hypothetical protein  27.74 
 
 
171 aa  50.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1904  hypothetical protein  35.06 
 
 
125 aa  50.8  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000231633  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  40 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0525  hypothetical protein  30 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.865789 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0065  peroxiredoxin-like protein  26.8 
 
 
193 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1403  hypothetical protein  27.92 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  32.05 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>