More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0494 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  100 
 
 		 168 aa  335  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  58.79 
 
 		 173 aa  194  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  55.62 
 
 		 175 aa  184  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  56.9 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  52.98 
 
 		 175 aa  177  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  53.85 
 
 		 175 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  53.25 
 
 		 175 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  53.25 
 
 		 175 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  53.25 
 
 		 175 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  52.66 
 
 		 175 aa  173  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  51.74 
 
 		 174 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  51.74 
 
 		 174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  52.02 
 
 		 174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  52.02 
 
 		 174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  52.02 
 
 		 174 aa  171  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  52.02 
 
 		 174 aa  171  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  52.02 
 
 		 174 aa  171  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  51.74 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  51.45 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  50.88 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0924  rhodanese domain-containing protein  51.76 
 
 		 176 aa  138  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  43.04 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  39.29 
 
 		 181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  38.22 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  43.95 
 
 		 182 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  37.71 
 
 		 194 aa  106  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  42.59 
 
 		 190 aa  95.1  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  37.87 
 
 		 197 aa  89.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  38.29 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  35.06 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  34.5 
 
 		 225 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  34.5 
 
 		 225 aa  80.9  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  34.48 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3362  rhodanese domain-containing protein  38.07 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  40.37 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  30.6 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  34.5 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  35.8 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  33.55 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  35.37 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  31.21 
 
 		 221 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  31.21 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  32.68 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  31.21 
 
 		 221 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  32.56 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 		 112 aa  70.5  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  36.75 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 		 119 aa  67  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  44.33 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  34.29 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  41 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  36.26 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 204 aa  63.9  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  37.25 
 
 		 132 aa  63.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  35.11 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  37.11 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1937  rhodanese-like protein  39.45 
 
 		 120 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  38.78 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  33.98 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  35.58 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  36.45 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.78 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  34.41 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  35.48 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  35.48 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  36.28 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  35.48 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0403  rhodanese domain-containing protein  39.6 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.059592  hitchhiker  0.000249249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  34.41 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  35.48 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  34.41 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.31 
 
 		 216 aa  57.4  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  28 
 
 		 476 aa  57.4  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  34.52 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  32.67 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  33.64 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  43.02 
 
 		 703 aa  55.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  37.37 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  43.02 
 
 		 703 aa  55.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.71 
 
 		 390 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4642  Rhodanese domain protein  37.89 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.845465  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  33.01 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  33 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 		 480 aa  53.9  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  33.65 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 		 269 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  39.22 
 
 		 102 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.04 
 
 		 393 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  30.84 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>