More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3362 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3362  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 197 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  60.11 
 
 		 199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  58.79 
 
 		 194 aa  215  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  55.8 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  55.8 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  55.8 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  55.25 
 
 		 192 aa  204  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  55.98 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  55.43 
 
 		 225 aa  201  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  54.44 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  54.17 
 
 		 189 aa  177  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  49.18 
 
 		 197 aa  164  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  50.6 
 
 		 189 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  43.81 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  47.85 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 218 aa  141  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  49.35 
 
 		 204 aa  134  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  43.21 
 
 		 194 aa  121  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  46.41 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  44.59 
 
 		 182 aa  111  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  41.56 
 
 		 177 aa  107  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  42.33 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  37.01 
 
 		 185 aa  98.2  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  38.27 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  36.48 
 
 		 190 aa  89  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  37.82 
 
 		 173 aa  88.2  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  33.99 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  38.07 
 
 		 168 aa  80.9  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  34.42 
 
 		 175 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  34.66 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  33.92 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  33.92 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  33.92 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  34.64 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  33.92 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  33.92 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  34.57 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  31.68 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  31.06 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  31.06 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  32.26 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  32.26 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  32.26 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  30.43 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  36.14 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 		 130 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  33.73 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  38.55 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  36.71 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  37.35 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  36.9 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  36.9 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  35.8 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 144 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  33.94 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  29.07 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0809  rhodanese domain-containing protein  39.08 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.321585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  44.58 
 
 		 125 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  43.37 
 
 		 703 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  47.37 
 
 		 105 aa  60.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  43.37 
 
 		 703 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  39.02 
 
 		 711 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  40.74 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  37.35 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  36.14 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  38.37 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  35.71 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  40.24 
 
 		 711 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0794  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase/rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 		 558 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  37.66 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  33.02 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  29.17 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  33.73 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  34.83 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  43.04 
 
 		 386 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4503  rhodanese-like domain protein  33.72 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000135209 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  39.08 
 
 		 389 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  29.9 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  37.66 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  35.48 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  35.71 
 
 		 99 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 127 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  35.48 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 127 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1537  rhodanese-related sulfurtransferase  35.9 
 
 		 106 aa  57.8  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>