134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1646 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1646  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  34.81 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  37.43 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  37.5 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172427 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 221 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  34.04 
 
 		 178 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2293  hypothetical protein  36.26 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000207442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  36.32 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  36.7 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  36.32 
 
 		 225 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  33.52 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  34.78 
 
 		 175 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  36.09 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  31.35 
 
 		 174 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  31.35 
 
 		 174 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2788  putative inner membrane protein  31.89 
 
 		 174 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.34112 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  34.64 
 
 		 175 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  34.64 
 
 		 175 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  34.64 
 
 		 175 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  34.64 
 
 		 175 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  31.35 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  31.35 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  31.35 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  31.35 
 
 		 174 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  31.35 
 
 		 174 aa  85.9  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  31.52 
 
 		 172 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  33.52 
 
 		 175 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  31.49 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2274  rhodanese domain-containing protein  32.4 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  29.94 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  30.6 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  30.72 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  33.16 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  33.16 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.73 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  32.98 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  30.46 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3362  rhodanese domain-containing protein  34.66 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  35.65 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  30.94 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  31.32 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  30.6 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0203  Rhodanese domain protein  29.9 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0924  rhodanese domain-containing protein  29.79 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  39.77 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21280  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.86 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.781801  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  36.7 
 
 		 113 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  33.68 
 
 		 140 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  28 
 
 		 140 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  28.7 
 
 		 123 aa  52  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  33.68 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  33.68 
 
 		 151 aa  49.3  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  29.7 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 113 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  26.73 
 
 		 123 aa  48.5  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  27.18 
 
 		 103 aa  48.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  26.21 
 
 		 140 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  34.72 
 
 		 116 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  33.72 
 
 		 116 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  29.9 
 
 		 135 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  29.9 
 
 		 135 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  32.04 
 
 		 121 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  25.24 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  29.9 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  29.9 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.04 
 
 		 386 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  25.24 
 
 		 140 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  25.24 
 
 		 140 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  25.24 
 
 		 140 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  29.9 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  29.9 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  29.9 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  30.39 
 
 		 120 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  25.24 
 
 		 140 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  26.21 
 
 		 161 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0838  aminotransferase, class V  28.57 
 
 		 778 aa  46.2  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0677783  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 		 130 aa  45.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  30.19 
 
 		 116 aa  45.4  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  28.87 
 
 		 229 aa  45.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  27.19 
 
 		 173 aa  45.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.07 
 
 		 392 aa  45.4  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  28.42 
 
 		 269 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  28.3 
 
 		 138 aa  45.1  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.19 
 
 		 390 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.67 
 
 		 380 aa  45.1  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 110 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0741  rhodanese-like domain-containing protein  29.9 
 
 		 110 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.138504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0779  rhodanese-like domain-containing protein  29.9 
 
 		 110 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  27.84 
 
 		 135 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  26.04 
 
 		 138 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05030  hypothetical protein  28.21 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0689  rhodanese-like domain-containing protein  29.59 
 
 		 119 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.152263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0675  rhodanese-like domain-containing protein  29.59 
 
 		 119 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.852423  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  27.1 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0373  rhodanese-like  40 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.370743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0873  rhodanese-like domain protein  29.59 
 
 		 119 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000378208 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  29.9 
 
 		 141 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0566  aminotransferase class V  27.68 
 
 		 771 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>