More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05030 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05030  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  335  9.999999999999999e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4822  Rhodanese domain protein  37.88 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20859 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  35.2 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  34.23 
 
 		 480 aa  67  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2099  Rhodanese domain protein  32.74 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0523024  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  33.98 
 
 		 480 aa  64.3  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  29.32 
 
 		 141 aa  63.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  25.77 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  34.94 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  25.77 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1444  Rhodanese domain protein  31.78 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000128878  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 470 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 284 aa  61.6  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  35.42 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  37 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  26.17 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.24 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  32.97 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  34.02 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  32.65 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  35.24 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  31.87 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  32.58 
 
 		 282 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1647  rhodanese domain-containing protein  28.81 
 
 		 319 aa  57.4  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0453671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  31.19 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  27.42 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  31.63 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  31.63 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  31.63 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  32.65 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  31.01 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  30 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1575  rhodanese domain-containing protein  30.84 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00593854  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.69 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  29.9 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  31.71 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  36.25 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  34.44 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  29.41 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  35.71 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  33.77 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  27.47 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  30.68 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  29.32 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  26.37 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  34.95 
 
 		 456 aa  54.7  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.16 
 
 		 389 aa  54.7  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  31.82 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 		 393 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  32.97 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  32.97 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0088  rhodanese domain-containing protein  30.39 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00487418 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  31.65 
 
 		 288 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  26.37 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  26.37 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  26.37 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  26.37 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  26.37 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  28.37 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  30.23 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  28.57 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  31.68 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  42.59 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  27.72 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  28.43 
 
 		 119 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.21 
 
 		 386 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  40.85 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  30 
 
 		 280 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33 
 
 		 395 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0972  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30 
 
 		 390 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1901  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  27.55 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  29.25 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.52 
 
 		 938 aa  52.8  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  28.09 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  27.47 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  30.53 
 
 		 125 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  29.81 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  29.7 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  35.53 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  31.37 
 
 		 260 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  31.46 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  33.63 
 
 		 117 aa  53.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  29.63 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  29.7 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  31.37 
 
 		 260 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  31.9 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  28.99 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  32.94 
 
 		 127 aa  52.4  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  30.85 
 
 		 119 aa  52.4  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  27.01 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  29.03 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  26.09 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  29.03 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>