241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2099 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2099  Rhodanese domain protein  100 
 
 
191 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0523024  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1444  Rhodanese domain protein  56.03 
 
 
154 aa  170  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000128878  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1575  rhodanese domain-containing protein  55.32 
 
 
154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00593854  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1901  Rhodanese domain protein  46.84 
 
 
159 aa  161  6e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4822  Rhodanese domain protein  38.58 
 
 
173 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20859 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  30.47 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05030  hypothetical protein  32.74 
 
 
163 aa  67  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  31.53 
 
 
123 aa  62.4  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  35.85 
 
 
170 aa  61.2  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  34.74 
 
 
142 aa  60.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  32.71 
 
 
127 aa  58.2  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  37.27 
 
 
390 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  30.19 
 
 
118 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  30.56 
 
 
141 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  35.48 
 
 
170 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  28.18 
 
 
116 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  32.32 
 
 
111 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 
103 aa  55.1  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.17 
 
 
392 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  33.03 
 
 
144 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.27 
 
 
390 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  28.48 
 
 
148 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.45 
 
 
390 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  35.65 
 
 
247 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  24.31 
 
 
129 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4423  rhodanese-like protein  27.73 
 
 
116 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  30.19 
 
 
125 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 
127 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.48 
 
 
550 aa  52.4  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 
185 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  26.14 
 
 
148 aa  51.6  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  30 
 
 
133 aa  51.2  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.33 
 
 
392 aa  51.6  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  28.18 
 
 
197 aa  51.2  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  30.48 
 
 
138 aa  51.2  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.63 
 
 
568 aa  51.2  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  32.32 
 
 
129 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0094  rhodanese-like protein  32.73 
 
 
110 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.04 
 
 
387 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  25 
 
 
129 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2905  hypothetical protein  30.36 
 
 
390 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  28.97 
 
 
154 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0773  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 
117 aa  50.1  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  31.19 
 
 
423 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1859  Rhodanese domain protein  32.65 
 
 
314 aa  49.7  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52383  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  30.91 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3191  hypothetical protein  30.36 
 
 
390 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.755733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  29.46 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 
114 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  27.88 
 
 
113 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  30.84 
 
 
108 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  28.43 
 
 
124 aa  49.3  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 
478 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  31.86 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  27.36 
 
 
170 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  28.43 
 
 
124 aa  49.3  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  32.65 
 
 
118 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1399  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.38 
 
 
400 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1417  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.38 
 
 
400 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1453  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.38 
 
 
400 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.640225  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 
271 aa  48.5  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.84 
 
 
386 aa  48.5  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  31.62 
 
 
110 aa  48.5  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  27.66 
 
 
126 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.84 
 
 
383 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 
113 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 
140 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  32.41 
 
 
112 aa  48.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  26.32 
 
 
144 aa  48.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  30.61 
 
 
141 aa  47.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  30.53 
 
 
109 aa  47.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  32.32 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1108  hypothetical protein  25.66 
 
 
391 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000685928  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  29.73 
 
 
118 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.84 
 
 
383 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.19 
 
 
397 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.171411 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.48 
 
 
392 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 
178 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 
141 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  28.68 
 
 
140 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  32.26 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  31.68 
 
 
379 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  26.61 
 
 
181 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0972  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.84 
 
 
390 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  29.36 
 
 
194 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  26.89 
 
 
144 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  28.44 
 
 
113 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  28.04 
 
 
113 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  29.17 
 
 
140 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  26.05 
 
 
149 aa  46.6  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.07 
 
 
817 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0095  Rhodanese domain protein  26.67 
 
 
106 aa  46.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.819142  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  29.09 
 
 
113 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.78 
 
 
393 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  28.93 
 
 
152 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  33 
 
 
377 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  24.56 
 
 
144 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  27.78 
 
 
393 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 
110 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  25.23 
 
 
149 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>