More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1059 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 141 aa  286  9e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0957  Rhodanese domain protein  44.76 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  47.27 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  42.99 
 
 		 151 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  48.98 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  47.96 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 141 aa  89.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  37.96 
 
 		 154 aa  87  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  37.23 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  37.8 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  36.52 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  38.18 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 220 aa  77  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  35.83 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  40.66 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  35.04 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  32.23 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  31 
 
 		 685 aa  73.9  0.0000000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  44.58 
 
 		 170 aa  73.6  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  35 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  38.24 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 		 269 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  38.52 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  38.75 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  35.14 
 
 		 480 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  30.6 
 
 		 173 aa  67  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  41.77 
 
 		 103 aa  67  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  34.52 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  30.77 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  30.77 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  29.81 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  30.77 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  30.77 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  34.41 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  30.77 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06440  lipoprotein, putative  30 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  34.38 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  37.08 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  32.58 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  28.7 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.27 
 
 		 392 aa  64.7  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  37.21 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  43.9 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  30.77 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.24 
 
 		 393 aa  63.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  37.5 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  40.28 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  31.06 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.73 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  31.46 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  38.64 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  37.5 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  36.79 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  36.79 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  37 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  29.81 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  40.51 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  38.82 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  37.8 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  31.54 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  37.21 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  34.15 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  31.67 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.14 
 
 		 390 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  28.85 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.65 
 
 		 386 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3484  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.02 
 
 		 561 aa  61.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.36 
 
 		 390 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  38.89 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.74 
 
 		 395 aa  60.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  39.53 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 		 278 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  25.56 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  39.76 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0959  thiosulfate sulfurtransferase  30.37 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 		 197 aa  60.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2404  protein of unknown function DUF156  31.68 
 
 		 201 aa  60.5  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  32.58 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  39.81 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0470  Rhodanese domain protein  39.36 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.571299  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.93 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  39.36 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>