More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3058 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  100 
 
 		 110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  61.82 
 
 		 110 aa  142  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  60.55 
 
 		 110 aa  137  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  58.18 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  60.38 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  55.24 
 
 		 109 aa  120  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  58.49 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  51.35 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  51.43 
 
 		 113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  52.88 
 
 		 115 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  51.35 
 
 		 111 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  50.98 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  57.14 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  48.62 
 
 		 113 aa  103  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  47.71 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  47.17 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  46.67 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  51.52 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  46.3 
 
 		 116 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  46.3 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  52.88 
 
 		 116 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  46.3 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  47.41 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  48.18 
 
 		 111 aa  92.8  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  43.3 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  46.32 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  53.25 
 
 		 189 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0167  Rhodanese domain protein  43.64 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  43.75 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4423  rhodanese-like protein  44.35 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  46.53 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  51.22 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  46.51 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  45.05 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  45.16 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  50.68 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  48.65 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  45.56 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  46.75 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  42.59 
 
 		 565 aa  75.5  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  45.24 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  45.35 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  49.32 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50 
 
 		 383 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  47.95 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  49.32 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  49.32 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  49.32 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  49.32 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  40.38 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  43.01 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.68 
 
 		 383 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0868  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  38.1 
 
 		 554 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120121 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  49.37 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0684  NADH dehydrogenase  38.1 
 
 		 554 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  46.58 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000245472  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4865  rhodanese-like domain protein  37.36 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0395  rhodanese-like domain protein  37.36 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4560  rhodanese domain-containing protein  37.36 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.17 
 
 		 478 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4841  rhodanese-like domain protein  37.36 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000626615  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  49.33 
 
 		 471 aa  70.5  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  41.11 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4626  rhodanese-like domain-containing protein  36.26 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4461  rhodanese-like domain-containing protein  36.26 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4479  rhodanese-like domain-containing protein  36.26 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0848615  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4981  rhodanese-like domain-containing protein  36.26 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4847  rhodanese-like domain protein  36.26 
 
 		 101 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  38.37 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3405  rhodanese domain-containing protein  35.87 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  47.95 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000125485 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2916  CoA-disulfide reductase  39.29 
 
 		 547 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  48.68 
 
 		 356 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  40.23 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  51.32 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  42.35 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  41.86 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  51.32 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 		 817 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4871  rhodanese-like domain-containing protein  36.26 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  40.96 
 
 		 484 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0935  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  37.65 
 
 		 554 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000203969  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.96 
 
 		 478 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.96 
 
 		 478 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  40.96 
 
 		 478 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  40.96 
 
 		 484 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  51.32 
 
 		 356 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  51.32 
 
 		 356 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  38.82 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  38.82 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3752  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.02 
 
 		 551 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  38.82 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  41.11 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0774  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase, class I  37.65 
 
 		 554 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  48.68 
 
 		 356 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>