More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2475 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 108 aa  221  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  59.8 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  57.43 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  56.44 
 
 		 108 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  53.47 
 
 		 118 aa  110  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  55.45 
 
 		 108 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  54.46 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  57.14 
 
 		 111 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  49.09 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  54.64 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  55.1 
 
 		 137 aa  100  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  52.63 
 
 		 175 aa  96.7  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  46.53 
 
 		 185 aa  95.9  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2590  rhodanese domain-containing protein  48.48 
 
 		 113 aa  90.5  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5025  Rhodanese domain protein  47.12 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.569347 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0678  Rhodanese domain protein  43.43 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.682716 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  45.54 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  46.15 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  40.74 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  40 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  41.84 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  41.9 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  43.3 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1330  rhodanese domain-containing protein  41.75 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.434015 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5363  Rhodanese domain protein  45 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  39 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  38.68 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5070  rhodanese domain-containing protein  44.9 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.34245  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  43.81 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  34.34 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  33.93 
 
 		 123 aa  67  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  32.35 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  41.46 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  37.89 
 
 		 480 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  37.63 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  35.24 
 
 		 320 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  29.41 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.95 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  40.7 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2371  rhodanese-like protein  39.8 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000779942  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  34.58 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  43.96 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  43.96 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  40.45 
 
 		 168 aa  62  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  43.96 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  43.96 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  41.86 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  43.96 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  39.81 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  30.48 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.87 
 
 		 399 aa  62  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  43.82 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  38.3 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.01 
 
 		 398 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  36.89 
 
 		 216 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.37 
 
 		 393 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  43.02 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  33.7 
 
 		 269 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1620  rhodanese domain-containing protein  41.41 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000202366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.85 
 
 		 393 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  31.9 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  35.79 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  30.91 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  32.69 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0095  Rhodanese domain protein  38.24 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.819142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  36.36 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3005  Rhodanese domain-containing protein  41.75 
 
 		 228 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.603948  normal  0.106826 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  40.74 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  44.16 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  34.78 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  32.99 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.68 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1937  rhodanese-like protein  44.71 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  37.23 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.35 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  34.41 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  38.54 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  34.57 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  35.05 
 
 		 461 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  38.38 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  35.24 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.1 
 
 		 403 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>