More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5070 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5070  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
106 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.34245  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5363  Rhodanese domain protein  88.68 
 
 
106 aa  189  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  70.75 
 
 
107 aa  154  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  70.75 
 
 
107 aa  154  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5025  Rhodanese domain protein  69.81 
 
 
107 aa  150  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.569347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  66.04 
 
 
106 aa  143  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0678  Rhodanese domain protein  50.51 
 
 
110 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.682716 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1330  rhodanese domain-containing protein  48.48 
 
 
112 aa  87.4  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.434015 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2590  rhodanese domain-containing protein  45.71 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  42.42 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  44.9 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  45.16 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  39.22 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  39 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  40.78 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  39 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  38.78 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  40.59 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  37.25 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  37.25 
 
 
137 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3170  Rhodanese domain protein  43.02 
 
 
224 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  35.51 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  47.62 
 
 
105 aa  60.1  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  35.9 
 
 
137 aa  59.3  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  34.48 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  40.24 
 
 
118 aa  58.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  41.24 
 
 
221 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  39.56 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  43.21 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  42.5 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  42.5 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  42.5 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  42.5 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  42.5 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  42.5 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  42.5 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  40 
 
 
345 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  37.21 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  42.5 
 
 
127 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  34.65 
 
 
177 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  39.25 
 
 
186 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  41.25 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  39.53 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  43.68 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  35.51 
 
 
189 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  41.25 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.29 
 
 
403 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  41.86 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  37.35 
 
 
389 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  38.24 
 
 
124 aa  53.9  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  40.45 
 
 
216 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  41.76 
 
 
101 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  38.27 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  37.23 
 
 
98 aa  53.5  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
130 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  39.24 
 
 
181 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  37.65 
 
 
278 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  34.07 
 
 
120 aa  52  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05040  endoplasmic reticulum protein, putative  34.78 
 
 
179 aa  52.4  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.575301  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 
220 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  34.69 
 
 
393 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  37.5 
 
 
346 aa  52  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.53 
 
 
393 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
186 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  40.23 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3482  rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  41.46 
 
 
147 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
186 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  33.33 
 
 
186 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  31 
 
 
185 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 
190 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  39.51 
 
 
102 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  33.98 
 
 
296 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  36.05 
 
 
141 aa  51.2  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
128 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 
141 aa  51.2  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 
186 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  32.22 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  36 
 
 
361 aa  50.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  41.25 
 
 
277 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.25 
 
 
392 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.35 
 
 
389 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  34.41 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  38.83 
 
 
221 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 
118 aa  50.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.78 
 
 
386 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  34.38 
 
 
136 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  37.21 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  33.73 
 
 
186 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  38.46 
 
 
346 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.8 
 
 
393 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>