More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0678 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0678  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 110 aa  224  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.682716 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1330  rhodanese domain-containing protein  71.84 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.434015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5025  Rhodanese domain protein  53.77 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.569347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  49.06 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  52.83 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  52.83 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5363  Rhodanese domain protein  51.52 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5070  rhodanese domain-containing protein  50.51 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.34245  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  44.55 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  45.54 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  47.96 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  46.46 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2590  rhodanese domain-containing protein  50.98 
 
 		 113 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  45.1 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  44.44 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  43.43 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  45.1 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  43.88 
 
 		 137 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  46.08 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  42.39 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  42.72 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  39 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  45.26 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  43.82 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  41.84 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.09 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  43.16 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  43.16 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  45.35 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.56 
 
 		 393 aa  64.7  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  44.33 
 
 		 460 aa  64.3  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  38.24 
 
 		 186 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  40.22 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  42.86 
 
 		 389 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  40.66 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  41.24 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.8 
 
 		 392 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  41.18 
 
 		 393 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.83 
 
 		 386 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  30.63 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  36.17 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  32.35 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3170  Rhodanese domain protein  44.83 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  36.79 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  34.02 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  31.9 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  45.35 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.37 
 
 		 386 aa  58.9  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  35.16 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  35.51 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  32.98 
 
 		 463 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  37.62 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  35.63 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  33.96 
 
 		 423 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  39.6 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  36.61 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  37.36 
 
 		 120 aa  57  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  33.02 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  39.13 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  32.14 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  44.71 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.86 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  32.73 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0994  hypothetical protein  31.19 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186232  normal  0.0867734 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  31.31 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  34.04 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  34.26 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3386  hypothetical protein  32.41 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0847115 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  30.93 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  37.04 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  35.92 
 
 		 470 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  34.58 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  35.11 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  39.74 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  34 
 
 		 471 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 		 278 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  33.33 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  35.65 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  33.65 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  40.23 
 
 		 356 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  37.78 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  35.11 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  37.8 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>