More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3684 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  100 
 
 		 113 aa  230  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1330  rhodanese domain-containing protein  42.61 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.434015 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0678  Rhodanese domain protein  46.08 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.682716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  47.13 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  46.94 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5363  Rhodanese domain protein  48.28 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  37.21 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  35.58 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  35.25 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  36.94 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  43.68 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  43.68 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  32.11 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5025  Rhodanese domain protein  43.68 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.569347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  38.68 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  40.59 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  33.61 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  43.37 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  45.45 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  48.75 
 
 		 356 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  32.23 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5070  rhodanese domain-containing protein  45.16 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.34245  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  35.42 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  45.78 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  41.24 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  46.05 
 
 		 711 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  42.7 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 		 480 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  42.17 
 
 		 194 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  44.44 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  30.83 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  47.5 
 
 		 356 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  45.68 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  47.5 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  32.23 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  47.62 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  39.62 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  35.16 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  32.23 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  47.5 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  41.49 
 
 		 389 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  31.19 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  34.34 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  32.97 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  40.24 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  36.17 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  32.23 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  33.03 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  36.71 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  36.71 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  39.74 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  43.02 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  32.23 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  33.01 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  39.74 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  36.73 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  45.12 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  47.5 
 
 		 356 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  37.25 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 197 aa  63.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  38.14 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  43.9 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  41.94 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  39.8 
 
 		 189 aa  63.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  43.9 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  32.23 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  47.5 
 
 		 356 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  47.5 
 
 		 356 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  42.68 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  40 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  43.9 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  34.91 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  37.65 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  37.18 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000245472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  35.85 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  42.68 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  36 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  36.7 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  43.21 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  36 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  38.37 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  34.04 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  34.44 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1907  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.25 
 
 		 364 aa  60.5  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 		 271 aa  60.5  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>