More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5363 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5363  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 106 aa  214  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5070  rhodanese domain-containing protein  88.68 
 
 		 106 aa  189  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.34245  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  68.87 
 
 		 107 aa  152  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  68.87 
 
 		 107 aa  152  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5025  Rhodanese domain protein  67.92 
 
 		 107 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.569347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  66.04 
 
 		 106 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0678  Rhodanese domain protein  51.52 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.682716 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1330  rhodanese domain-containing protein  47.42 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.434015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  41.35 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  48.28 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2590  rhodanese domain-containing protein  46.67 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  40.38 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  40.74 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  45 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  41.58 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  39.42 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  40 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  38.46 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  37.5 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  40.78 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  41.76 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  36.27 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  36.47 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  36.45 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  45.35 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  40.19 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3170  Rhodanese domain protein  41.86 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  42.53 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  34.29 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  43.68 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  33 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  35.56 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  39.33 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  44.05 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.64 
 
 		 403 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.38 
 
 		 389 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  43.62 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  40.21 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  33.04 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.71 
 
 		 393 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  35.51 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  39.08 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  39.08 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  40.96 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  38.55 
 
 		 389 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  42.67 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  41.25 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  41.38 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  40 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  32.58 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  40 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  40 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  40 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  40 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  36.36 
 
 		 361 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  40 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  40 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  40 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.08 
 
 		 392 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  40 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  38.38 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  32.14 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  34.88 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  35.42 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 		 220 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  42.05 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  40 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  38.75 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  31.37 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3482  rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  40.91 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.08 
 
 		 393 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  38.14 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1431  rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  38.14 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  37.63 
 
 		 345 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  33.98 
 
 		 296 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  32.61 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  33.72 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  33.33 
 
 		 189 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 269 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  29.29 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 		 282 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  39.53 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  43.56 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>