More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2500 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  100 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  42.57 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  43.56 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  46 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  46 
 
 		 269 aa  78.2  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  45.28 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  44.94 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  43.3 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  41.41 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  39.53 
 
 		 116 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  40.95 
 
 		 113 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  45.78 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  38.98 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  47.62 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  45.26 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  37.62 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  30.95 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  37.25 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  39.05 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  44.05 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  44.05 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.96 
 
 		 383 aa  64.3  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  38.32 
 
 		 223 aa  64.3  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  39.13 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  38.24 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  39 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0678  Rhodanese domain protein  38.24 
 
 		 110 aa  63.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.682716 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  39.74 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  39.05 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  40.66 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  30.26 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.7 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  37.18 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  37.18 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  45 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  41.76 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  41.84 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  34.33 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  38.54 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  37.76 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  34.91 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  42.39 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  41.38 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  39.78 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  42.22 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  36.44 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  36.19 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  39.6 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  36.46 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  37.62 
 
 		 98 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 		 116 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  38.46 
 
 		 116 aa  60.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 		 130 aa  60.5  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5363  Rhodanese domain protein  40.19 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1907  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.01 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  28.46 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  38.39 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  40.96 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  43.53 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  39.08 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  36.45 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  32.97 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  45.56 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  38.37 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4423  rhodanese-like protein  39.77 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300405 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  37.78 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  37.74 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.56 
 
 		 478 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0296  Rhodanese domain protein  38.82 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  38.53 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.56 
 
 		 478 aa  58.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.56 
 
 		 478 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  40 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  36.56 
 
 		 478 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.76 
 
 		 390 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  31.15 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  38.53 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  38.14 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  36.56 
 
 		 484 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  36.56 
 
 		 484 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>