More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2435 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
106 aa  215  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5025  Rhodanese domain protein  75.47 
 
 
107 aa  168  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.569347 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  73.58 
 
 
107 aa  167  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  73.58 
 
 
107 aa  167  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5363  Rhodanese domain protein  66.04 
 
 
106 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5070  rhodanese domain-containing protein  66.04 
 
 
106 aa  143  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.34245  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0678  Rhodanese domain protein  49.06 
 
 
110 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.682716 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1330  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
112 aa  93.6  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.434015 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  46.53 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  45.54 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2590  rhodanese domain-containing protein  48.08 
 
 
113 aa  84  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  45.92 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  44.9 
 
 
111 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  44.55 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  42.45 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  43.56 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  45.54 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  47.13 
 
 
113 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  39.22 
 
 
118 aa  76.6  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  41.58 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  45.05 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  35.05 
 
 
185 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  37.37 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  35.85 
 
 
361 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  35.64 
 
 
177 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3170  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 
224 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2517  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  37.38 
 
 
665 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  34.31 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  34.31 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 
284 aa  60.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 
296 aa  60.5  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  39.56 
 
 
120 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  35.92 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  37.14 
 
 
186 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  39.08 
 
 
216 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  36.27 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  34.09 
 
 
167 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  34.88 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  34.38 
 
 
389 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  38.89 
 
 
393 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.36 
 
 
392 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  34.88 
 
 
128 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  40.19 
 
 
346 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  35.16 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  34.58 
 
 
189 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.37 
 
 
386 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  30.3 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  37.89 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  41.35 
 
 
346 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.31 
 
 
386 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  34.44 
 
 
201 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  39.18 
 
 
220 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.26 
 
 
393 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2623  rhodanese domain-containing protein  29.82 
 
 
283 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.26 
 
 
390 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  36.47 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.57 
 
 
395 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  37 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  30.3 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.48 
 
 
189 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 
190 aa  53.9  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  29.52 
 
 
136 aa  53.9  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  41.98 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42.35 
 
 
392 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0718  UBA/THIF-type NAD/FAD-binding protein  33.33 
 
 
390 aa  53.9  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 
290 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.76 
 
 
387 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  40.26 
 
 
390 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  34.41 
 
 
189 aa  53.5  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  32.22 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  34.88 
 
 
135 aa  52.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  37.5 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.3 
 
 
393 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  30.1 
 
 
269 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.96 
 
 
390 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  40.7 
 
 
356 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.65 
 
 
397 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.171411 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  42.31 
 
 
277 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3005  Rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
228 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.603948  normal  0.106826 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  38.96 
 
 
280 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  41.18 
 
 
390 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  36.17 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0936  rhodanese-like protein  35.23 
 
 
181 aa  52  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0889376  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  37.63 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  37.8 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  36.05 
 
 
201 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  34.19 
 
 
133 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  38.96 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  38.96 
 
 
124 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  35.71 
 
 
142 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 
113 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>