More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2517 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2517  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  100 
 
 		 665 aa  1340    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  54.47 
 
 		 623 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1298  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  52.68 
 
 		 411 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2927  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  51.83 
 
 		 412 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.818096  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  52.31 
 
 		 296 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0267  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  48.29 
 
 		 392 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2948  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain- containing protein  45.04 
 
 		 366 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1978  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain protein  43.06 
 
 		 347 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0560  iron-sulfur cluster-binding protein  24.23 
 
 		 370 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0544  cysteine-rich domain-contain protein  24.51 
 
 		 370 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.77 
 
 		 758 aa  158  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.139736  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1874  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.06 
 
 		 377 aa  150  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3439  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.8 
 
 		 796 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0903  hypothetical protein  29.28 
 
 		 367 aa  134  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1873  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.22 
 
 		 390 aa  134  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.24 
 
 		 776 aa  133  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.98211  hitchhiker  0.000275945 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1575  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.37 
 
 		 797 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0497596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 769 aa  120  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0221  Fe-S oxidoreductase  29.55 
 
 		 771 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.6 
 
 		 771 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2072  hypothetical protein  24.48 
 
 		 423 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1822  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.08 
 
 		 802 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.5 
 
 		 784 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.293744  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1550  hypothetical protein  27.04 
 
 		 788 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1809  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  28.03 
 
 		 768 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.175846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1275  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 356 aa  114  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000898965  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0640  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.91 
 
 		 902 aa  112  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112639 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3271  Fe-S oxidoreductase  23.87 
 
 		 763 aa  112  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02676  hypothetical protein  27.38 
 
 		 256 aa  111  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3540  aldehyde dehydrogenase, iron-sulfur subunit  28.57 
 
 		 836 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1560  rhodanese domain-containing protein  30.83 
 
 		 321 aa  107  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000411556  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  33.19 
 
 		 291 aa  101  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  33.75 
 
 		 290 aa  99.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  32.39 
 
 		 280 aa  94  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  33.69 
 
 		 285 aa  93.6  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3863  hypothetical protein  32.12 
 
 		 249 aa  92.4  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.64 
 
 		 285 aa  90.9  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  25.9 
 
 		 321 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.21 
 
 		 793 aa  90.1  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0641  iron-sulfur binding reductase  23.57 
 
 		 330 aa  90.1  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  25.9 
 
 		 321 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  29.58 
 
 		 286 aa  90.1  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4507  rhodanese-like protein  29.2 
 
 		 286 aa  89.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0454  Rhodanese domain protein  32.51 
 
 		 298 aa  89  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.45 
 
 		 284 aa  89  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1721  hypothetical protein  27.18 
 
 		 549 aa  88.6  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.180785 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  24.89 
 
 		 289 aa  88.6  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  29.44 
 
 		 366 aa  88.2  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  29.73 
 
 		 290 aa  87.8  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2858  Rhodanese domain protein  25.38 
 
 		 305 aa  87.8  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  31.2 
 
 		 288 aa  87.8  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  27.88 
 
 		 300 aa  87.8  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  31.64 
 
 		 282 aa  87.8  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.83 
 
 		 289 aa  87.4  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  30.33 
 
 		 297 aa  86.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  30.49 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  27.62 
 
 		 272 aa  85.5  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.97 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  28.46 
 
 		 265 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  33.05 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0747  rhodanese domain-containing protein  29.55 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.544739 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0139  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  26.44 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  29.57 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  31.45 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  31.54 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  31.3 
 
 		 288 aa  83.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  30.12 
 
 		 297 aa  83.6  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  29.15 
 
 		 285 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.6 
 
 		 284 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  29.6 
 
 		 284 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  28.89 
 
 		 284 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  32.24 
 
 		 281 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  27.1 
 
 		 282 aa  82.8  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  28.45 
 
 		 278 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.71 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  26.35 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  30.45 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.29 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  27.46 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.07 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  26.79 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  30.42 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.56 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1180  thiosulfate sulfurtransferase  31.45 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384238  normal  0.0141759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  32.24 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.06 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  33.59 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  26.42 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.39 
 
 		 717 aa  80.5  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  29.8 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02073  rhodanese-related sulfurtransferase  26.09 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161687  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0220  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  26.22 
 
 		 487 aa  80.5  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.804076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.39 
 
 		 284 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  27.92 
 
 		 282 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  28.15 
 
 		 320 aa  80.1  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  30.89 
 
 		 284 aa  80.1  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  28.45 
 
 		 284 aa  80.1  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1348  hypothetical protein  24.67 
 
 		 617 aa  80.5  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.39 
 
 		 299 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.92 
 
 		 282 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>