More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1914 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  100 
 
 		 141 aa  286  7e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  89.36 
 
 		 140 aa  257  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  87.68 
 
 		 138 aa  254  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  81.43 
 
 		 141 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  80.43 
 
 		 137 aa  229  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  72.26 
 
 		 137 aa  202  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  66.92 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  64.8 
 
 		 134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  54.07 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  69.23 
 
 		 127 aa  141  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  51.82 
 
 		 138 aa  140  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  51.16 
 
 		 140 aa  130  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  50.39 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  51.94 
 
 		 140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  53.23 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  48.39 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  61.05 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  49.19 
 
 		 136 aa  123  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  50.41 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  45.67 
 
 		 130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  44.88 
 
 		 130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  46.83 
 
 		 128 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  44.53 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  44.53 
 
 		 131 aa  104  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  44.88 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  41.41 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  41.41 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  40.48 
 
 		 125 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  38.28 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  37.5 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  40.46 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  37.9 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  45.24 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  35.16 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1109  rhodanese-like  60 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  40.43 
 
 		 345 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  33.87 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  34.71 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  33.09 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  33.88 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  40.21 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  44.09 
 
 		 344 aa  70.5  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  31.2 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  37.89 
 
 		 346 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  31.2 
 
 		 133 aa  67  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  38.33 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.89 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.88 
 
 		 388 aa  65.5  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  38.55 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  38.95 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  38.95 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  34.71 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  33.63 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  34.43 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  33.86 
 
 		 346 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  35.85 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  32.76 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  31.97 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  36.84 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  37.11 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  31.78 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.01 
 
 		 393 aa  61.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  35.54 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  30.08 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  33.6 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  35.34 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  32.56 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1257  hypothetical protein  42.5 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.265625  normal  0.967549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  30.91 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  35.79 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  31.15 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  29.27 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  32.52 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  32.2 
 
 		 294 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  32.76 
 
 		 361 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  35.78 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  30.4 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  32.2 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  39.78 
 
 		 476 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  30.4 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  30.4 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  30.51 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  34.82 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  35.71 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  38.82 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  39.36 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  33.59 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  35.51 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  39.36 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  31.18 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>