153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4940 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 124 aa  245  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  66.67 
 
 		 134 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  63.56 
 
 		 130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  63.79 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  62.5 
 
 		 294 aa  137  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  59.82 
 
 		 138 aa  137  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  56.03 
 
 		 163 aa  130  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  58.26 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  57.89 
 
 		 124 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  57.89 
 
 		 124 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  57.89 
 
 		 124 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  54.7 
 
 		 140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  55.65 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  54.1 
 
 		 133 aa  124  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  51.72 
 
 		 122 aa  120  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  52.14 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  65.12 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  52.59 
 
 		 131 aa  107  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  43.88 
 
 		 204 aa  96.7  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  36.94 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  35.59 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  33.61 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  34.45 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  36.21 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  35.79 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  33.9 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  32.23 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  37.63 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  39.08 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  37.21 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  35.48 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  34.48 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  33.62 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  28.95 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  35.96 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  35.56 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  30.17 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  32.56 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  31.53 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  35.45 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  31.03 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  30.4 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  34.48 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  41.86 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  41.86 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  29.55 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  41.24 
 
 		 346 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  30.77 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  33.05 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  32.43 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  35.59 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  36.45 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0291  Rhodanese domain protein  38.78 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.49635 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  31.36 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  38.66 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.62 
 
 		 480 aa  55.1  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  38.82 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  25 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  37.65 
 
 		 467 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  31.9 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0934  Rhodanese domain protein  34.88 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.20591  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  30.83 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  30.51 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.91 
 
 		 388 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  30.83 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  34.43 
 
 		 354 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06090  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.35 
 
 		 379 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00932  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.35 
 
 		 379 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  29.55 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 459 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2517  rhodanese domain-containing protein  34.58 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.299389  normal  0.344118 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  26.15 
 
 		 134 aa  50.1  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.51 
 
 		 393 aa  50.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  24.14 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1461  ankyrin repeat-containing protein  33.72 
 
 		 258 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  25 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  31.82 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  26.05 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.58 
 
 		 389 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.28 
 
 		 380 aa  48.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  31.03 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  29.31 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  38.16 
 
 		 460 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  39.53 
 
 		 459 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  29.89 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  28.81 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  32.77 
 
 		 323 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  32.69 
 
 		 479 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1990  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  29.47 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0570  hypothetical protein  36.47 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.739902  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  34.48 
 
 		 346 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  36.17 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  32.65 
 
 		 345 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>