285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3082 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  100 
 
 
131 aa  260  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  59.35 
 
 
130 aa  135  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  58.4 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  68.09 
 
 
204 aa  128  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  52.76 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  52.67 
 
 
163 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  55.65 
 
 
140 aa  120  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  56.45 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  54.03 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  49.21 
 
 
131 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  50.39 
 
 
131 aa  105  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  48.33 
 
 
124 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  48.33 
 
 
124 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  48.33 
 
 
124 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  51.69 
 
 
124 aa  100  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  48.25 
 
 
122 aa  100  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  48.25 
 
 
122 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  44.35 
 
 
138 aa  97.1  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  46.43 
 
 
294 aa  88.2  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  39.83 
 
 
129 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0291  Rhodanese domain protein  37.72 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.49635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  33.61 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  36.59 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  34.68 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  32.31 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  33.06 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  35.25 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  32.2 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  31.2 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  31.45 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  38.02 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  36.54 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  33.07 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  37.61 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  33.06 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
126 aa  62.8  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.67 
 
 
380 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0934  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.20591  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  43.14 
 
 
459 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  38.53 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.07 
 
 
480 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  31.09 
 
 
131 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  30 
 
 
125 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  39.82 
 
 
170 aa  60.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  31.09 
 
 
131 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  28.81 
 
 
130 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  34.17 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  33.06 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  31.58 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  33.33 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  33.7 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.77 
 
 
388 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  33.61 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  31.2 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  32.03 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  27.05 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  32.14 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  26.27 
 
 
130 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  39.58 
 
 
346 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  34.43 
 
 
323 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  36.94 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  34.51 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  34.51 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
138 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  32.76 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 
476 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  32.08 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  26.52 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  28.07 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  32.11 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  32.77 
 
 
361 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  33.04 
 
 
220 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
438 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  30.43 
 
 
345 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  26.12 
 
 
159 aa  52  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 
119 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  29.66 
 
 
130 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  33.94 
 
 
129 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  35.34 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  34.68 
 
 
119 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  30.43 
 
 
125 aa  51.2  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  30.51 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  29.17 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  27.69 
 
 
131 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  31.36 
 
 
141 aa  50.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  31.97 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  31.97 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.7 
 
 
393 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  31.9 
 
 
346 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  28.7 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  27.12 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  34.23 
 
 
459 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  34.43 
 
 
406 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>