More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2537 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  100 
 
 
130 aa  268  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  73.85 
 
 
130 aa  206  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  58.06 
 
 
134 aa  149  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  59.06 
 
 
127 aa  148  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  51.49 
 
 
141 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  50.39 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  52.38 
 
 
140 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  51.59 
 
 
138 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  53.23 
 
 
129 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  47.24 
 
 
136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  51.61 
 
 
137 aa  133  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  52.42 
 
 
137 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  50.39 
 
 
141 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1109  rhodanese-like  80.28 
 
 
71 aa  127  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  51.18 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  51.69 
 
 
131 aa  124  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  45.6 
 
 
138 aa  122  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  47.2 
 
 
140 aa  120  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  46.4 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  50.98 
 
 
133 aa  118  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  43.44 
 
 
130 aa  103  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  43.7 
 
 
130 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  39.23 
 
 
131 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  42.62 
 
 
128 aa  100  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  43.44 
 
 
128 aa  100  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  42.02 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
131 aa  94.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  39.84 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  37.69 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  37.69 
 
 
130 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  38.98 
 
 
125 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  36 
 
 
126 aa  89.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  34.62 
 
 
130 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  39.37 
 
 
129 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  35.56 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  34.43 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  41.24 
 
 
344 aa  67.8  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  33.03 
 
 
345 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  31.71 
 
 
323 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 
128 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  37.76 
 
 
128 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.5 
 
 
389 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  36.29 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  39.25 
 
 
113 aa  60.5  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  31.2 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  36.22 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  35.42 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  37.4 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  34.95 
 
 
346 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  34.38 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  35.24 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  35.35 
 
 
178 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  31.09 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  31.06 
 
 
354 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.9 
 
 
388 aa  57.4  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  34.48 
 
 
108 aa  57.4  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  33.06 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  30.56 
 
 
346 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  28.7 
 
 
361 aa  57  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  35.59 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.1 
 
 
393 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  29.6 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  35.59 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  35.59 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  35.59 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  36.22 
 
 
346 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  36.19 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  32.74 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  31.86 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 
290 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  26.19 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  31.5 
 
 
133 aa  55.1  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  26.19 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  31.75 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  32.76 
 
 
131 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  27.59 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  31.86 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  35 
 
 
271 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  36.61 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  36.61 
 
 
119 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  36.28 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1744  Rhodanese domain protein  40 
 
 
112 aa  52  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.664688  normal  0.136709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 
204 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  34.04 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  32 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1940  rhodanese-like protein  34.58 
 
 
388 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.865805  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  32.23 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1431  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430812  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01280  hypothetical protein  28.57 
 
 
117 aa  51.6  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000449614  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05040  endoplasmic reticulum protein, putative  33.64 
 
 
179 aa  52  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.575301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  30.25 
 
 
119 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
148 aa  51.2  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  33.04 
 
 
227 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1257  hypothetical protein  34.57 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.265625  normal  0.967549 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0630  Rhodanese domain protein  39.78 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  28.15 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04039  Rhodanese domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03960)  35 
 
 
232 aa  50.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.864941  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  31.19 
 
 
463 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>