265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01280 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01280  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  241  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000449614  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1238  hypothetical protein  43.16 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2086  rhodanese-like protein  47.27 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  39.78 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  39.08 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  41.89 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  41.89 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  36.47 
 
 		 323 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.82 
 
 		 388 aa  64.3  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  43.84 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  43.24 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.11 
 
 		 393 aa  63.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  38.96 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  37.63 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  36.25 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 		 389 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  35.04 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  36.45 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  43.28 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  31.15 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  32.14 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  32.5 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  35.51 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  30.36 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  38.04 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  32.35 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  31.93 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  40.91 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  31.9 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.71 
 
 		 380 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  36.36 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  38.81 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  29.82 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  38.81 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  32.61 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  32.14 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.71 
 
 		 480 aa  55.1  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  43.24 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  33.64 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  34.41 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  34.85 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  35.23 
 
 		 116 aa  52.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  35.14 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  28.57 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  38.46 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  32.94 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  33.72 
 
 		 171 aa  50.4  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  27.12 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  32.56 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  38.36 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  35.37 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 		 466 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  33.73 
 
 		 279 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  30 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  33.62 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  29.47 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  30.36 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  27.71 
 
 		 529 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3405  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  28.18 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  34.67 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  37.18 
 
 		 476 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  31.87 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  40.54 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  34.62 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  37.88 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  37.5 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1960  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 478 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0558054  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0688  beta-lactamase domain-containing protein  34.44 
 
 		 450 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.715713  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 459 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  27.71 
 
 		 529 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  34.92 
 
 		 354 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  28.1 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  34.85 
 
 		 194 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  38.81 
 
 		 186 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 		 185 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4841  rhodanese-like domain protein  34.07 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000626615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4847  rhodanese-like domain protein  34.07 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4626  rhodanese-like domain-containing protein  34.07 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  38.81 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4461  rhodanese-like domain-containing protein  34.07 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4479  rhodanese-like domain-containing protein  34.07 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0848615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  38.81 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4981  rhodanese-like domain-containing protein  34.07 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4865  rhodanese-like domain protein  34.07 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  37.18 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2892  beta-lactamase domain-containing protein  37.68 
 
 		 452 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>