More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1901 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 137 aa  280  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  61.94 
 
 		 136 aa  184  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  48.41 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  42.06 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  42.06 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  34.65 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  34.59 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  43.8 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  36.94 
 
 		 158 aa  90.5  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  29.69 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  34.59 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2325  Rhodanese domain protein  33.07 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0667353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  30.4 
 
 		 161 aa  87  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40.2 
 
 		 390 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  37.82 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  43.1 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40.2 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  43.1 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.22 
 
 		 386 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  37.88 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  41.88 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  35.71 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  37.07 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  41.53 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  32.52 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  32.56 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  29.57 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  40.52 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.87 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  29.57 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  36.72 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  36.15 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.48 
 
 		 389 aa  74.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.38 
 
 		 392 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.71 
 
 		 398 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.24 
 
 		 392 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  29.51 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 		 361 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.25 
 
 		 386 aa  73.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  29.51 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  37.9 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  40.17 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  33.06 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  31.62 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  38.46 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  32.77 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 		 279 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  30.91 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  42.53 
 
 		 278 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  31.15 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  36.19 
 
 		 277 aa  70.5  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  32.77 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.51 
 
 		 395 aa  70.5  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  36.13 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  37.29 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.79 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  31.93 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  38.89 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  32.77 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  35.9 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.61 
 
 		 393 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  35.51 
 
 		 455 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  37.93 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.51 
 
 		 395 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  35.61 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  40.45 
 
 		 288 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  32.23 
 
 		 127 aa  67  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  39.22 
 
 		 189 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0095  Rhodanese domain protein  35.85 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.819142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  37.74 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  37.38 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  30.7 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  35.9 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  35.77 
 
 		 438 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  35.19 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  37.62 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  29.06 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0296  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  30.61 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.03 
 
 		 388 aa  65.1  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  34.38 
 
 		 346 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  31.78 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  38.61 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  34.21 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  35.51 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  36.28 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  32.46 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  33.33 
 
 		 711 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  35.42 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  35.29 
 
 		 389 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>