291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1579 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 131 aa  256  9e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  60 
 
 		 133 aa  141  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  60.98 
 
 		 130 aa  141  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  58.73 
 
 		 163 aa  140  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  60.16 
 
 		 134 aa  139  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  53.97 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  55.37 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  63.79 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  55.08 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  53.98 
 
 		 294 aa  110  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  52.25 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  46.05 
 
 		 204 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  53.15 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  49.21 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  52.1 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  52.1 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  52.1 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  54.13 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  55.67 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0934  Rhodanese domain protein  44.55 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.20591  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  35.59 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  38.1 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  32.28 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  37.17 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  32.81 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  37.72 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  33.88 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  32.26 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0291  Rhodanese domain protein  38 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.49635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  32.81 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  31.97 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  37.89 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  39.08 
 
 		 361 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  33.88 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  34.13 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  34.13 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  35.48 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  32.54 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  31.4 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  34.15 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  34.13 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.45 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  33.08 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  33.04 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  35.79 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  35.4 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  31.9 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  28.45 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  34.83 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  31.25 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  30 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  39.78 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  34.44 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  39.78 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  32.35 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  36.28 
 
 		 216 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  36.27 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  32.74 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06090  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.26 
 
 		 379 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00932  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.26 
 
 		 379 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  36.84 
 
 		 345 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  32.04 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.56 
 
 		 386 aa  51.6  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  33.63 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  37.36 
 
 		 467 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.56 
 
 		 379 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  36.46 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  29.03 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  39.05 
 
 		 459 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  39.05 
 
 		 459 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  27.55 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  39.05 
 
 		 459 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  26.85 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  34.55 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  34.26 
 
 		 109 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  26.89 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  30.08 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  33.64 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  32.98 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  33.94 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  33.06 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  35.59 
 
 		 617 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  32.38 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  31.86 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  32.29 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  33.91 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  28.26 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  30.08 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  34.48 
 
 		 334 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 		 225 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  34.82 
 
 		 480 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  36.79 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>