87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3323 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 138 aa  270  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  72.81 
 
 		 124 aa  169  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  72.81 
 
 		 124 aa  169  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  72.81 
 
 		 124 aa  169  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  75.44 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  69.49 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  70.69 
 
 		 294 aa  160  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  63.71 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  71.93 
 
 		 131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  64.04 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  59.52 
 
 		 163 aa  144  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  58.14 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  62.3 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  59.82 
 
 		 124 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  52.42 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  49.58 
 
 		 133 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  52.25 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  44.35 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  47.25 
 
 		 204 aa  84.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  35.34 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0291  Rhodanese domain protein  36.04 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.49635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  31.36 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  30.33 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  32.5 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  29.66 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  32.48 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  29.66 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  34.55 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  34.55 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  30.51 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  34.17 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  31.36 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  30.97 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  31.3 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  27.73 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  31.07 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  28.95 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  31.45 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  28.07 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  28 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0570  hypothetical protein  36.67 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.739902  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  32.73 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  32.14 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  30.3 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  29.81 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  32.35 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  30.95 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  32.22 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  30.69 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  30.7 
 
 		 361 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  31.13 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  31.58 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  28.69 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  29.03 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  29.84 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  29.84 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  25.81 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4001  hypothetical protein  36 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  28.57 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  30.23 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  27.05 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.28 
 
 		 388 aa  47.4  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  26.55 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.04 
 
 		 480 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 459 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.57 
 
 		 389 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5002  rhodanese domain-containing protein  28.16 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.589759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1990  Rhodanese domain protein  31.07 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  31.52 
 
 		 459 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  38 
 
 		 471 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  29.91 
 
 		 346 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  30.95 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0934  Rhodanese domain protein  29.9 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.20591  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.41 
 
 		 380 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  32.11 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  27.27 
 
 		 323 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  27.97 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 460 aa  41.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.78 
 
 		 393 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3613  rhodanese-like protein  32.95 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.31 
 
 		 484 aa  40.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>