131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3613 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3613  rhodanese-like protein  100 
 
 		 160 aa  322  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2167  rhodanese domain-containing protein  78.03 
 
 		 152 aa  214  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.548621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3516  rhodanese domain-containing protein  75.71 
 
 		 146 aa  214  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4049  rhodanese-like protein  71.83 
 
 		 147 aa  212  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0657384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1293  rhodanese domain-containing protein  76.52 
 
 		 146 aa  211  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0548  Rhodanese domain protein  72.26 
 
 		 149 aa  201  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0532  rhodanese domain-containing protein  72.26 
 
 		 159 aa  200  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210744  normal  0.0949792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4172  rhodanese domain-containing protein  71.64 
 
 		 159 aa  196  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4949  Rhodanese domain protein  68.99 
 
 		 137 aa  188  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3765  rhodanese-like protein  51.16 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0703444 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1556  hypothetical protein  51.97 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0120  rhodanese-like domain-containing protein  50.39 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0027  hypothetical protein  51.18 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.335991  normal  0.134752 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0757  rhodanese domain-containing protein  46.46 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187458  normal  0.496229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3646  Rhodanese domain protein  49.61 
 
 		 150 aa  114  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2626  rhodanese-like protein  47.2 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2287  rhodanese-like protein  48.44 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3513  rhodanese domain-containing protein  47.24 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4005  rhodanese domain-containing protein  47.24 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816307  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0929  rhodanese-like domain-containing protein  48.82 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0452  rhodanese-like domain-containing protein  48.82 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.401061  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0195  rhodanese-like domain-containing protein  48.82 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  48.82 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5788  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00528237 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0366  rhodanese-like domain-containing protein  48.82 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1909  rhodanese/Cdc25 fold  48.82 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.636231  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1822  rhodanese domain-containing protein  48.82 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0624  Rhodanese domain protein  44.53 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0538  rhodanese domain-containing protein  49.61 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1890  Rhodanese domain protein  50.38 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2139  rhodanese-like protein  48.03 
 
 		 176 aa  107  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109425  decreased coverage  0.0000830085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20970  Rhodanese-like protein  50.39 
 
 		 174 aa  107  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00660232  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2446  rhodanese-like protein  49.61 
 
 		 171 aa  101  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000105937  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0235  rhodanese-like protein  40.8 
 
 		 128 aa  97.4  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.661399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0151  rhodanese-like domain protein  40.8 
 
 		 132 aa  95.5  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0322  Rhodanese domain protein  40.8 
 
 		 132 aa  95.5  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.089082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0687  rhodanese domain-containing protein  46.43 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10394  hypothetical protein  47.18 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000112032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3859  rhodanese domain-containing protein  48.89 
 
 		 136 aa  92.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0002  rhodanese domain-containing protein  43.8 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000108771  hitchhiker  1.00132e-23 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2616  Rhodanese domain protein  45.38 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00605824  normal  0.758764 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2535  Rhodanese domain protein  39.85 
 
 		 143 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.607232  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0117  rhodanese-like protein  41.74 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2946  Rhodanese domain protein  47.26 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2063  rhodanese-like protein  44.27 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3209  rhodanese domain-containing protein  34.51 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3372  rhodanese-related sulfurtransferase  43.17 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5459  rhodanese-like protein  42.07 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1520  hypothetical protein  44.62 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000699946  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2059  rhodanese-like protein  45.8 
 
 		 154 aa  87  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4035  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 137 aa  86.3  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5927  rhodanese-like protein  41.38 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2150  rhodanese domain-containing protein  41.38 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1742  Rhodanese domain protein  37.88 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.354198 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2168  rhodanese domain-containing protein  41.38 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784132 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0512  Rhodanese domain protein  46.48 
 
 		 152 aa  85.1  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00637526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35020  Rhodanese-related sulfurtransferase  45.52 
 
 		 143 aa  84.7  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1482  hypothetical protein  43.08 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0535  Rhodanese domain protein  43.7 
 
 		 142 aa  84  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2060  rhodanese domain-containing protein  41.35 
 
 		 154 aa  84  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2851  rhodanese domain-containing protein  43.24 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131553  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3644  Rhodanese domain protein  42.96 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2187  rhodanese domain-containing protein  37.11 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.992479  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0220  rhodanese domain-containing protein  46.72 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0086  rhodanese-like protein  41.96 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0525  rhodanese-like protein  48.18 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0537  rhodanese domain-containing protein  48.18 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0661648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0515  rhodanese domain-containing protein  48.18 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1490  rhodanese domain-containing protein  37.88 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1177  Rhodanese domain protein  42.75 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1085  Rhodanese domain protein  42.75 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0171  rhodanese-like protein  33.08 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3477  Rhodanese domain protein  47.79 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1257  hypothetical protein  44.27 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.737183 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1121  rhodanese domain-containing protein  41.26 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.461947 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1744  hypothetical protein  41.26 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.260357  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0048  rhodanese-like protein  39.64 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2771  rhodanese-like protein  41.26 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1843  rhodanese-like domain-containing protein  40.56 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2254  hypothetical protein  41.26 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3066  hypothetical protein  41.26 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43904  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2636  hypothetical protein  41.26 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2692  hypothetical protein  41.26 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.340906  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1525  hypothetical protein  41.26 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.131173  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3119  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1274  Rhodanese domain protein  42.24 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0733136  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0296  hypothetical protein  38.74 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0150  Rhodanese domain protein  39.64 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0157  Rhodanese domain protein  37.84 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2392  Rhodanese domain protein  41.35 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.881675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0955  rhodanese-like protein  31.75 
 
 		 271 aa  57  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0394414  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2496  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  34.62 
 
 		 108 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  35.79 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3551  hypothetical protein  30.4 
 
 		 222 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502988 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2329  Rhodanese domain protein  29.37 
 
 		 197 aa  48.9  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128974  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0685  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  35.29 
 
 		 251 aa  48.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162364  normal  0.0193697 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0959  thiosulfate sulfurtransferase  34.78 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  31.15 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4079  hypothetical protein  32.32 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>