63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5002 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_5002  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 104 aa  201  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.589759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0291  Rhodanese domain protein  45.71 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.49635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  38 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0934  Rhodanese domain protein  45.05 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.20591  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  35.19 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  30.84 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  41.67 
 
 		 390 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  32.41 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  36.47 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  33.64 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.94 
 
 		 392 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  34.94 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  36 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  30.39 
 
 		 294 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 		 461 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  34 
 
 		 459 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  32.58 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  34.15 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  31.76 
 
 		 220 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  33.73 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  33.75 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  36.47 
 
 		 406 aa  44.3  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  32.05 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  31.73 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  28.16 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  34.88 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  34.52 
 
 		 269 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  32.95 
 
 		 345 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2168  Rhodanese domain protein  32.5 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  34.34 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34290  Rhodanese-related sulfurtransferase  38.46 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.128356 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  30.3 
 
 		 470 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  31.52 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  36.59 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  36.08 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  32.95 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.38 
 
 		 390 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  29.89 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35 
 
 		 386 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  35.29 
 
 		 170 aa  41.2  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  35.71 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2697  rhodanese domain-containing protein  35.35 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  34.62 
 
 		 389 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3482  rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  34.62 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  34.09 
 
 		 346 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  26.97 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  31.48 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  33.98 
 
 		 346 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  32.91 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  35.8 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1272  Rhodanese domain protein  34.09 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  36.11 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>