73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4233 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
124 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
124 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  100 
 
 
124 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  83.19 
 
 
122 aa  196  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  81.51 
 
 
122 aa  191  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  85.95 
 
 
131 aa  190  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  72.81 
 
 
138 aa  169  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  73.04 
 
 
294 aa  156  8e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  64.41 
 
 
134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  62.3 
 
 
140 aa  143  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  64.71 
 
 
163 aa  143  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  65 
 
 
127 aa  140  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  61.98 
 
 
141 aa  137  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  57.38 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  57.89 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  52.59 
 
 
133 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  52.1 
 
 
131 aa  107  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  48.33 
 
 
131 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  48.91 
 
 
204 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  35.04 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  33.06 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  35.83 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0291  Rhodanese domain protein  39.42 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.49635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  32.17 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  30.65 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  28.93 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  32.79 
 
 
137 aa  57.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  33.02 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  31.45 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  33.71 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  33.08 
 
 
141 aa  57  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  28.7 
 
 
131 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  31.52 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  30.4 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  30.84 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  31.45 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  31.71 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  31.3 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  31.86 
 
 
361 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  33.7 
 
 
128 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  30.7 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  28.18 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5002  rhodanese domain-containing protein  33.64 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.589759  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0934  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
143 aa  47.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.20591  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  28.83 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  34.15 
 
 
130 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  32.56 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  37.93 
 
 
459 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  27.59 
 
 
131 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1990  Rhodanese domain protein  34.83 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  29.92 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.13 
 
 
480 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0570  hypothetical protein  32.18 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.739902  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  28.18 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  28.09 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  28.32 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  28.32 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  27.19 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  31.46 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  30.23 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.84 
 
 
393 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.06 
 
 
388 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  28.21 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  31.31 
 
 
106 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  29.91 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  32.58 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  32.58 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  24.56 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>