More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0934 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0934  Rhodanese domain protein  100 
 
 
143 aa  267  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.20591  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0291  Rhodanese domain protein  47.54 
 
 
125 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.49635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  41.28 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  41.12 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  46.15 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  40.19 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  42.31 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  43.14 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  43.4 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  39.45 
 
 
149 aa  67  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34290  Rhodanese-related sulfurtransferase  43.26 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.128356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  39.05 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  34.92 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
119 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  39.22 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5002  rhodanese domain-containing protein  45.05 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.589759  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  31.97 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  35.51 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  39.56 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  39.42 
 
 
204 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3482  rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  34.02 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  34.86 
 
 
126 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.24 
 
 
380 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 
124 aa  54.3  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  35.87 
 
 
220 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  32.22 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  35.42 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  40.45 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  31.13 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  35.42 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  34.69 
 
 
106 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.94 
 
 
480 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1990  Rhodanese domain protein  38.32 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  35.42 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1362  rhodanese-like protein  38.14 
 
 
334 aa  52  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  42.98 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  38 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.7 
 
 
378 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  36.26 
 
 
106 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0253  Rhodanese domain protein  32.56 
 
 
265 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 
101 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  33.33 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  35.29 
 
 
294 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  36.78 
 
 
254 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  36.54 
 
 
133 aa  50.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  34.95 
 
 
126 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  31.73 
 
 
102 aa  50.8  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  34.41 
 
 
122 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  39.51 
 
 
112 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  35 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  35.11 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  34.78 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  33.71 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  39.33 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  32.61 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  38.2 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  35.23 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  38.2 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0687  beta-lactamase domain-containing protein  32.04 
 
 
378 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.596111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  30.47 
 
 
222 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  32.38 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  38.37 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  28.7 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  37.36 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  35.16 
 
 
123 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  32.61 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  30.84 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  33.7 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  34.12 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  31.19 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2024  Rhodanese domain protein  31.13 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 
263 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  32.95 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  32.95 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 
460 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  30.68 
 
 
101 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  31.13 
 
 
177 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  32.58 
 
 
103 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  30.68 
 
 
101 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  30.77 
 
 
142 aa  47.8  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  30.68 
 
 
101 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
149 aa  47.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  30.68 
 
 
101 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 
278 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  36.27 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  33.96 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  28.32 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  32.74 
 
 
480 aa  47  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  32.71 
 
 
106 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  35.71 
 
 
123 aa  47.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.21 
 
 
403 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 
101 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  33.71 
 
 
110 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 
136 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  32.26 
 
 
280 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>