82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4683 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
122 aa  239  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  84.3 
 
 
122 aa  203  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  81.51 
 
 
124 aa  191  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  81.51 
 
 
124 aa  191  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  81.51 
 
 
124 aa  191  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  80.87 
 
 
131 aa  167  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  69.49 
 
 
138 aa  161  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  67.8 
 
 
294 aa  152  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  64.96 
 
 
140 aa  143  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  64.35 
 
 
134 aa  139  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  65.79 
 
 
127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  63.48 
 
 
141 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  62.07 
 
 
163 aa  134  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  52.99 
 
 
130 aa  118  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  52.14 
 
 
124 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  54.13 
 
 
131 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  48.25 
 
 
131 aa  100  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  50 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  32.46 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  33.9 
 
 
141 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  32.74 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  35.78 
 
 
130 aa  62  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  36.79 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  34.21 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  34.26 
 
 
140 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  33.91 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  33.6 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  32.71 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  31.07 
 
 
129 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0291  Rhodanese domain protein  38 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.49635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  33.94 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  31.53 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  31.62 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  32.2 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  32.76 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  30.43 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  31.53 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  28.95 
 
 
126 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  31.03 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  31.4 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  29.09 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  32.56 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  31.86 
 
 
361 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  29.89 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  33.62 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  27.68 
 
 
136 aa  47  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  28.7 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000125485 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.62 
 
 
480 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5002  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.589759  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  30.58 
 
 
459 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  27.59 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4001  hypothetical protein  36.26 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  34.95 
 
 
459 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  34.95 
 
 
459 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  34.95 
 
 
459 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  28.16 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  27.68 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  29.91 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  29.31 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  26.55 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  29.31 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  28.16 
 
 
98 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  28.16 
 
 
98 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1990  Rhodanese domain protein  34.09 
 
 
110 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  34.95 
 
 
459 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  28.16 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  26.42 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0543  beta-lactamase domain protein  43.18 
 
 
471 aa  41.2  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327684 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  29.57 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  30.12 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00932  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.56 
 
 
379 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0570  hypothetical protein  31.03 
 
 
124 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.739902  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06090  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.56 
 
 
379 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  30.12 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  32.04 
 
 
459 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0934  Rhodanese domain protein  32.18 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.20591  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  31.33 
 
 
123 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>