16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0570 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0570  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  239  7e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.739902  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4001  hypothetical protein  44.94 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  36 
 
 
138 aa  53.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  35.96 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  34.78 
 
 
294 aa  50.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  32.18 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  32.18 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  32.18 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  34.52 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  29.91 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  35.8 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  32.69 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  27.38 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  28.41 
 
 
141 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 
122 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3613  rhodanese-like protein  31.52 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>