83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11084 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  252  9e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  85.95 
 
 
124 aa  204  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  85.95 
 
 
124 aa  204  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  85.95 
 
 
124 aa  204  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  77.78 
 
 
122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  80.87 
 
 
122 aa  179  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  71.93 
 
 
138 aa  165  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  68.7 
 
 
294 aa  150  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  66.39 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  64.06 
 
 
134 aa  140  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  63.93 
 
 
140 aa  140  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  61.67 
 
 
127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  61.02 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  55.73 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  56.52 
 
 
124 aa  116  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  50.39 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  55.36 
 
 
133 aa  114  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  50 
 
 
131 aa  107  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  52.22 
 
 
204 aa  90.9  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  37.07 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  34.21 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  33.63 
 
 
137 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  34.41 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  38.27 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  33.71 
 
 
127 aa  58.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  33.65 
 
 
130 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  34.62 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  32.71 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  33.9 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0291  Rhodanese domain protein  41.3 
 
 
125 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.49635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  31.06 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  36.08 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  36.9 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  33.7 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  36 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  37.63 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  35.71 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  31.93 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  37.04 
 
 
140 aa  52.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  31.36 
 
 
136 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  34.74 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  29.79 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0570  hypothetical protein  35.63 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.739902  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  32.63 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  30.09 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1990  Rhodanese domain protein  34 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 
131 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  34.04 
 
 
131 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  27.97 
 
 
125 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  34.07 
 
 
130 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0934  Rhodanese domain protein  33.7 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.20591  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  32.56 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  30.91 
 
 
361 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  32.11 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  32.11 
 
 
128 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  30.91 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  34.02 
 
 
131 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  28.21 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.07 
 
 
388 aa  43.9  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06090  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.89 
 
 
379 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  34.07 
 
 
346 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  35.63 
 
 
459 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00932  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.89 
 
 
379 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  29.29 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  25.2 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  26.15 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3613  rhodanese-like protein  38.37 
 
 
160 aa  42  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1461  ankyrin repeat-containing protein  34.55 
 
 
258 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.46 
 
 
480 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 
113 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  29.46 
 
 
136 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  30.95 
 
 
136 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4001  hypothetical protein  36.56 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  33.06 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.78 
 
 
389 aa  40.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  29.81 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  35.16 
 
 
459 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  32.14 
 
 
143 aa  40  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>