More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0229 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 
106 aa  223  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  83.02 
 
 
106 aa  193  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  76.19 
 
 
107 aa  179  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  76.7 
 
 
107 aa  179  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  64.42 
 
 
108 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  60.38 
 
 
109 aa  146  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  60.38 
 
 
109 aa  146  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  60.38 
 
 
109 aa  146  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  61.54 
 
 
110 aa  143  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  58.88 
 
 
108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  58.88 
 
 
108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  58.88 
 
 
108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  58.88 
 
 
108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  57.94 
 
 
108 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  56.07 
 
 
108 aa  131  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  56.07 
 
 
108 aa  131  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  56.07 
 
 
108 aa  131  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  56.07 
 
 
108 aa  131  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  56.07 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  56.07 
 
 
108 aa  131  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  55.14 
 
 
108 aa  130  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  55.14 
 
 
108 aa  130  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  55.14 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  58.16 
 
 
106 aa  124  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  50.94 
 
 
106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  50.47 
 
 
110 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  50.47 
 
 
110 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  57.14 
 
 
106 aa  121  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 
109 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  56 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  50 
 
 
106 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  50.94 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  56.57 
 
 
106 aa  117  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  49.53 
 
 
110 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  51.49 
 
 
106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  49.06 
 
 
109 aa  114  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  49.06 
 
 
109 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  48.57 
 
 
110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  46.67 
 
 
110 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
102 aa  108  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0122  thiosulfate sulfurtransferase  52.87 
 
 
108 aa  107  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  48.48 
 
 
101 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  48.48 
 
 
102 aa  101  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  45.45 
 
 
103 aa  101  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  46.94 
 
 
101 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  46.94 
 
 
101 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  46.94 
 
 
101 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  46.94 
 
 
101 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  46.94 
 
 
123 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  46.94 
 
 
101 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  47.42 
 
 
102 aa  99.4  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  46.94 
 
 
101 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 
102 aa  98.2  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  46.94 
 
 
101 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 
102 aa  97.1  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  45.92 
 
 
101 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  48.45 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  51.81 
 
 
110 aa  92.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  39.81 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  44 
 
 
103 aa  88.2  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0160  thiosulfate sulfurtransferase  39.22 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.460236  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  41.49 
 
 
263 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  41.25 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  41.56 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 
656 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  37.11 
 
 
260 aa  73.9  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  37.11 
 
 
260 aa  73.9  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  40 
 
 
254 aa  68.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  36.36 
 
 
280 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  37.78 
 
 
102 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  37.78 
 
 
102 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  36.36 
 
 
466 aa  64.3  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  29.29 
 
 
272 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  32.97 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  35.53 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  38.16 
 
 
282 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  37.84 
 
 
277 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  35 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  32.32 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  37.33 
 
 
113 aa  60.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  35.56 
 
 
102 aa  60.5  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  34.57 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4015  rhodanese-related sulfurtransferase  31.17 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0179275  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  32.35 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  31.17 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 
278 aa  59.3  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  34.57 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  35 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  34 
 
 
171 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 
480 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  33.71 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  31.08 
 
 
124 aa  57.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  31.25 
 
 
132 aa  57.8  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  31.08 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  27.84 
 
 
106 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
284 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  32.89 
 
 
229 aa  57.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  32.94 
 
 
271 aa  57  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>