15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1990 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1990  Rhodanese domain protein  100 
 
 
110 aa  219  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0291  Rhodanese domain protein  40.2 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.49635 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0934  Rhodanese domain protein  40.91 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.20591  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  31.82 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  35.48 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  29.52 
 
 
163 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  31.43 
 
 
130 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  34.83 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  31.07 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 
122 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  26.92 
 
 
137 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  32.04 
 
 
294 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>