More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6257 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  279  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  84.67 
 
 		 140 aa  237  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  80.43 
 
 		 138 aa  233  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  80.43 
 
 		 141 aa  229  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  76.81 
 
 		 141 aa  217  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  71.53 
 
 		 137 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  67.69 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  65.57 
 
 		 134 aa  164  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  57.97 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  53.23 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  54.89 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  51.61 
 
 		 130 aa  133  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  57.72 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  51.59 
 
 		 140 aa  131  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  51.13 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  63.44 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  49.17 
 
 		 136 aa  125  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  48.76 
 
 		 136 aa  123  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  46.77 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  47.15 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  45.97 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  47.46 
 
 		 131 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  44.35 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  43.2 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  42.74 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  40.5 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  38.4 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  40.8 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  38.4 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  39.2 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  40.5 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  45.08 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1109  rhodanese-like  58.46 
 
 		 71 aa  80.5  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  40.52 
 
 		 345 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  39.8 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  39.8 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  41.03 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  37.19 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  34.17 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  42.11 
 
 		 344 aa  70.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  38.14 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  35.25 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  38.3 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  32.79 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  37.23 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  37.6 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  37.82 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  34.96 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.59 
 
 		 389 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  34.15 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  36.11 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  35.19 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  39.29 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  35.79 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  32.5 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  31.9 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.25 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  34.92 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  33.61 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  32.82 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  33.05 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  39.08 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  34.43 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  34.26 
 
 		 346 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1257  hypothetical protein  42.5 
 
 		 93 aa  60.1  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.265625  normal  0.967549 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  31.97 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  33.91 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  32.14 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  31.86 
 
 		 361 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  31.15 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  32.87 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  38.66 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  35.19 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  32.79 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  32.79 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  32.79 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  38.61 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  35.63 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  31.67 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  34.41 
 
 		 204 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.45 
 
 		 393 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  34.96 
 
 		 459 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  30.89 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  34.96 
 
 		 459 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  35.79 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 459 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 459 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  30.77 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>