214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1483 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  100 
 
 		 140 aa  280  6.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  66.15 
 
 		 134 aa  170  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  65.15 
 
 		 163 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  72.58 
 
 		 127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  67.94 
 
 		 141 aa  157  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  66.67 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  62.3 
 
 		 124 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  62.3 
 
 		 124 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  62.3 
 
 		 124 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  64.96 
 
 		 122 aa  143  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  58.14 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  60.5 
 
 		 294 aa  131  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  53.91 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  69.23 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  55.37 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  54.7 
 
 		 124 aa  120  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  55.65 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  50.41 
 
 		 133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  46.31 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  36.36 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  36.97 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  34.71 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  34.71 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  33.33 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0934  Rhodanese domain protein  40.66 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.20591  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  35.77 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  35.25 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0291  Rhodanese domain protein  34.45 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.49635 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  32.17 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  37.61 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  34.13 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  31.15 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  31.25 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.87 
 
 		 480 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  33.6 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  31.13 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  34.43 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  33.62 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  32.67 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  38.24 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  30.08 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  36.07 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  32.79 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  31.67 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  31.67 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  32.46 
 
 		 361 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  32.11 
 
 		 130 aa  57  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  31.93 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  31.93 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  36.28 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  31.06 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  25.6 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  31.73 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  31.15 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  35.04 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  28.45 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 		 459 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  32.58 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  23.08 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  33.02 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  32.2 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  23.08 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  26.77 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.97 
 
 		 380 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  31.31 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  25 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  30.48 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  34.78 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  30.36 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  29.7 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1293  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268844 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  31.25 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3613  rhodanese-like protein  35.79 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4049  rhodanese-like protein  32.69 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0657384 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  25.45 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  24.19 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  33.65 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06090  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.61 
 
 		 379 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  29.63 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1990  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  34.21 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4949  Rhodanese domain protein  36.79 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00932  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.61 
 
 		 379 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3516  rhodanese domain-containing protein  35.79 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  25 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  30.39 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  36.26 
 
 		 459 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  36.26 
 
 		 459 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  36.26 
 
 		 459 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  34.07 
 
 		 346 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>