181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4982 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 127 aa  247  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  72.58 
 
 		 140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  63.64 
 
 		 134 aa  158  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  68.38 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  64.75 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  65 
 
 		 124 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  65 
 
 		 124 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  65 
 
 		 124 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  65.79 
 
 		 122 aa  150  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  62.3 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  62.3 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  56.1 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  61.21 
 
 		 294 aa  135  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  57.02 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  61.67 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  56.45 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  55.08 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  55.75 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  57.61 
 
 		 204 aa  103  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  38.66 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  34.45 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  34.45 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  36.36 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  34.71 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  34.68 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  33.61 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  32.79 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  34.68 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  35.77 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  34.75 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  32.23 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  36.8 
 
 		 361 aa  61.6  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0291  Rhodanese domain protein  35.51 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.49635 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.26 
 
 		 480 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  31.4 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  31.97 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  30.58 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  32.79 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  32.79 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  33.88 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  36.75 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  36.97 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  37.9 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  31.45 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  28 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  28.1 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0934  Rhodanese domain protein  39.56 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.20591  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  36.19 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  30.25 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  28.46 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  34.45 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  30.4 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  34.75 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  35.24 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  32.52 
 
 		 476 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.79 
 
 		 380 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  33.04 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  36.19 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  30.89 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  25.38 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  30 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  30 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  33.04 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  33.04 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  34.55 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  38.68 
 
 		 459 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  27.59 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  29.41 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  32.98 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  28.97 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  35.14 
 
 		 459 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  35.14 
 
 		 459 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  35.14 
 
 		 459 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  34.55 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  33.93 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  29.17 
 
 		 323 aa  48.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  31.43 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  29.37 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  30 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  25 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  28.89 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  33.63 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  28.93 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  35.19 
 
 		 459 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  35.09 
 
 		 460 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.3 
 
 		 388 aa  47.4  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  32.46 
 
 		 107 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  38.74 
 
 		 108 aa  47.4  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  27.78 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  32.61 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  30.28 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  30.48 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.96 
 
 		 393 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.95 
 
 		 389 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  37.23 
 
 		 346 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  28.71 
 
 		 479 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  28.18 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>