More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1239 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 131 aa  263  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  87.02 
 
 		 131 aa  236  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  86.26 
 
 		 131 aa  233  6e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  61.07 
 
 		 130 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  58.02 
 
 		 131 aa  175  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  58.78 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  57.26 
 
 		 126 aa  167  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  60.47 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  47.15 
 
 		 125 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  48.36 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  46.28 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  43.8 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  41.13 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  43.2 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  40.77 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  38.4 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  39.67 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  41.41 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  47.54 
 
 		 125 aa  95.1  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  39.84 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  39.2 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  38.21 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  40.16 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  40.46 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  42.71 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  38.93 
 
 		 138 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  36.61 
 
 		 136 aa  87.4  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  42.02 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  34.88 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  39.67 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  34.92 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  34.92 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  34.92 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  43.33 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  41.74 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  41.74 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  39.17 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  40.52 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  37.19 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  39.83 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  35.54 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  38.02 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  38.95 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  40.98 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  39.17 
 
 		 438 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  33.04 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  32.26 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  34.55 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2086  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  32.73 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.4 
 
 		 389 aa  60.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  37.89 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.61 
 
 		 388 aa  60.5  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.54 
 
 		 393 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  40.38 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  33.64 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  33.64 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  33.64 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  33.64 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  33.64 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  33.64 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  33.64 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  36.54 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  32.73 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  32.76 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  35.9 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  35.05 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  36.03 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  39.81 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2864  rhodanese-like domain-containing protein  34.74 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2549  rhodanese-like domain-containing protein  34.74 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1257  hypothetical protein  36.84 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.265625  normal  0.967549 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  40.52 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  31.82 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  36.45 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  33.67 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  39.5 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  28.95 
 
 		 323 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  34.13 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1238  hypothetical protein  29.91 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  33.65 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  37.4 
 
 		 346 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  39.13 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  39.76 
 
 		 467 aa  57  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  28.7 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  35.4 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  34.13 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  30.17 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  33.65 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  31.9 
 
 		 656 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01280  hypothetical protein  38.04 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000449614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  38.61 
 
 		 461 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>