249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2110 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  100 
 
 		 133 aa  270  7e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  64.57 
 
 		 131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  54.84 
 
 		 134 aa  141  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  50.38 
 
 		 136 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  57.26 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  49.6 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  56.3 
 
 		 138 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  53.44 
 
 		 141 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  50.39 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  49.61 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  56.3 
 
 		 140 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  62.64 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  52.8 
 
 		 141 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  46.34 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  56.14 
 
 		 137 aa  124  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  63.74 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  49.22 
 
 		 138 aa  115  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  48.31 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  46.88 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  41.41 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  40.62 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  39.84 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  40.62 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  41.6 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  40.8 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  40.34 
 
 		 130 aa  95.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  36.72 
 
 		 130 aa  93.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  39.67 
 
 		 128 aa  93.2  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  39.02 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  41.38 
 
 		 125 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  35.16 
 
 		 130 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1109  rhodanese-like  56.06 
 
 		 71 aa  84  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1257  hypothetical protein  52.56 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.265625  normal  0.967549 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  43.62 
 
 		 344 aa  78.2  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  38.71 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  40.57 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  40 
 
 		 346 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  37.1 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  39.22 
 
 		 346 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  33.61 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  34.45 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  35.94 
 
 		 128 aa  67  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  35.94 
 
 		 128 aa  67  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  34.96 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  31.15 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 323 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  34.45 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 467 aa  61.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  31.67 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  31.62 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  34.51 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  33.9 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  34.51 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  34.71 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.51 
 
 		 389 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  31.15 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  29.77 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  34.65 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  27.91 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  38.14 
 
 		 476 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  27.91 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  26.92 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  30.36 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  27.91 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  26.15 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  34.74 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  32.2 
 
 		 294 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  39.56 
 
 		 154 aa  52  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  32.71 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  39.08 
 
 		 346 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.03 
 
 		 393 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  32.79 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  29.17 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  30.93 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  29.84 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  31.46 
 
 		 105 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  33.02 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  32.63 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  32.5 
 
 		 127 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  28.44 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  31.93 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  32.03 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.39 
 
 		 393 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.41 
 
 		 392 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  31.96 
 
 		 548 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  32.35 
 
 		 393 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 		 459 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0847  Rhodanese domain protein  31.71 
 
 		 130 aa  48.1  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0158  hypothetical protein  26.13 
 
 		 391 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  31.06 
 
 		 438 aa  48.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  28.81 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>