268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0272 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  289  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  61.7 
 
 		 140 aa  173  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  59.42 
 
 		 134 aa  173  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  60.29 
 
 		 138 aa  167  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  59.85 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  54.55 
 
 		 136 aa  163  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  53.96 
 
 		 136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  56.93 
 
 		 130 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  57.97 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  55.73 
 
 		 129 aa  147  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  55.63 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  55.56 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  51.82 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  51.49 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  54.07 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  52.14 
 
 		 138 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  53.08 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  50.74 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  56.86 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  49.61 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  49.61 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  50.82 
 
 		 128 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  46.46 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  45.9 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  43.31 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  40.88 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  38.76 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  39.13 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1109  rhodanese-like  55.13 
 
 		 71 aa  91.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  36.23 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  35.66 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  34.88 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  34.88 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  36.57 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  40 
 
 		 345 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  35.07 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  41.54 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  39.53 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  43 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  32.54 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  36.76 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  31.75 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  36.76 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  40.37 
 
 		 346 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  38.05 
 
 		 346 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  40.62 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  33.07 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  35.35 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  31.3 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  35.66 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  34.92 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  40.62 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.6 
 
 		 388 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  34.59 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  34.59 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  34.59 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  34.59 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  33.87 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  29.46 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  34.13 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  30.53 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  32.03 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  31.36 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  35.23 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  38.14 
 
 		 476 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.06 
 
 		 389 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  33.6 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  31.06 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  28.68 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  30.83 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  35 
 
 		 476 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  34.4 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  29.79 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  31.78 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  33.08 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  33.08 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  33.08 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  32.77 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  39.37 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  33.04 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 438 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  29.01 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  30 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  37.63 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  33.63 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  31.06 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  31.85 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  26.52 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  34.59 
 
 		 346 aa  52.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1257  hypothetical protein  38.82 
 
 		 93 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.265625  normal  0.967549 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  29.13 
 
 		 144 aa  52  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  33.07 
 
 		 294 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  32.99 
 
 		 204 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  34.43 
 
 		 461 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>