More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1561 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 136 aa  283  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  80.15 
 
 		 136 aa  240  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  60.94 
 
 		 134 aa  179  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  54.55 
 
 		 141 aa  163  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  53.54 
 
 		 138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  50.77 
 
 		 130 aa  149  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  50.39 
 
 		 140 aa  146  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  48.82 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  50.39 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  51.67 
 
 		 127 aa  137  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  52.34 
 
 		 141 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  51.24 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  50.38 
 
 		 133 aa  134  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  53.17 
 
 		 131 aa  133  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  50.43 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  47.93 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  49.17 
 
 		 137 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  50.82 
 
 		 140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  48.39 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  49.18 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  48.31 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  47.83 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  44.72 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  46.96 
 
 		 128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  37.1 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  39.29 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  40.18 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  36.29 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  37.5 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  36.61 
 
 		 131 aa  87.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  36.75 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1109  rhodanese-like  50.7 
 
 		 71 aa  82  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  32.8 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  29.23 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  31.93 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  31.09 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  40.45 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  35.65 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  32.17 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  33.96 
 
 		 346 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  34.91 
 
 		 346 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  33.61 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  30.65 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  34.35 
 
 		 438 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  33.06 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  33.04 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  32.77 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  32.8 
 
 		 323 aa  67  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  29.31 
 
 		 361 aa  67  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  31.3 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  32.31 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  31.03 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  33.62 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  32.5 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.77 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  34.02 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  29.6 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  28.93 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  28.1 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  31.5 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  29.03 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  29.69 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  31.13 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  29.03 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  28.12 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.36 
 
 		 478 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  28.68 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  33.7 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 467 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  31.15 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  27.42 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  28.23 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  34.55 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  29.51 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  29.27 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  29.69 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.34 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.34 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  34.34 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  30.33 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  29.03 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  29.52 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  34.34 
 
 		 484 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  34.34 
 
 		 484 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  28.91 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  29.73 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  28.8 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  29.79 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  29.76 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  32.11 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>