More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1656 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 438 aa  899    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  54.72 
 
 		 318 aa  334  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  51.86 
 
 		 312 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  40.7 
 
 		 382 aa  216  9e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  36.99 
 
 		 367 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  37.37 
 
 		 378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  35.44 
 
 		 312 aa  180  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  32.38 
 
 		 337 aa  171  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  31.97 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 		 319 aa  133  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  30.31 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  30.71 
 
 		 318 aa  131  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  31.23 
 
 		 319 aa  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  31.12 
 
 		 309 aa  126  7e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  30.92 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  29.37 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  30.92 
 
 		 323 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  30.9 
 
 		 318 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  29.37 
 
 		 318 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  29.56 
 
 		 287 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  30.13 
 
 		 302 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  25.89 
 
 		 352 aa  113  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  29.08 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  29.22 
 
 		 299 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  28.72 
 
 		 323 aa  110  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  29.54 
 
 		 318 aa  109  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  28.01 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  28.9 
 
 		 321 aa  106  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.72 
 
 		 308 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 		 319 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  28.12 
 
 		 319 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  27.02 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 		 319 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  26.15 
 
 		 318 aa  100  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  24.74 
 
 		 310 aa  99  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  27.35 
 
 		 333 aa  99.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  28.46 
 
 		 308 aa  97.8  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  29.82 
 
 		 319 aa  98.2  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  27.48 
 
 		 347 aa  97.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 		 342 aa  97.1  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 		 319 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 		 319 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  25.27 
 
 		 346 aa  94.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  26.2 
 
 		 335 aa  94  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  26.2 
 
 		 335 aa  94  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  23.93 
 
 		 315 aa  94  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 312 aa  94  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 317 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  26.91 
 
 		 351 aa  93.6  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  27.95 
 
 		 300 aa  93.6  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 		 325 aa  93.6  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  25.82 
 
 		 319 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  26.77 
 
 		 300 aa  92.8  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  29.02 
 
 		 319 aa  92.8  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  24.63 
 
 		 317 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  25.66 
 
 		 319 aa  91.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 		 309 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 		 319 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  25.86 
 
 		 319 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  26.33 
 
 		 315 aa  90.1  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 		 336 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 		 307 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  24.62 
 
 		 316 aa  90.1  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  27.24 
 
 		 319 aa  89.7  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  25.77 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 		 307 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.09 
 
 		 318 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  26.77 
 
 		 342 aa  89.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  25.28 
 
 		 319 aa  89  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  26.22 
 
 		 315 aa  88.6  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  25.17 
 
 		 310 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  25.17 
 
 		 310 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 		 315 aa  87.8  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  24.05 
 
 		 316 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 		 339 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  27.11 
 
 		 329 aa  86.7  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  26.12 
 
 		 321 aa  86.3  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 		 332 aa  86.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 		 326 aa  86.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  25.1 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  24.72 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  27.63 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  25.7 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  27.16 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  26.99 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  28.11 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  22.14 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  28.27 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  25.38 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  26.58 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  27.5 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  26.84 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.23 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  33.81 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>