More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1475 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 119 aa  246  8e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  75 
 
 		 119 aa  190  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  73.95 
 
 		 119 aa  190  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  72.27 
 
 		 119 aa  184  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  64.71 
 
 		 119 aa  167  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  63.03 
 
 		 119 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  63.03 
 
 		 119 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  63.03 
 
 		 119 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  63.03 
 
 		 119 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  61.34 
 
 		 119 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  62.93 
 
 		 119 aa  159  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  60.5 
 
 		 119 aa  156  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  58.82 
 
 		 119 aa  148  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  53.04 
 
 		 125 aa  130  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  47.9 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  47.06 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  42.98 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  42.11 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  46.79 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  38.94 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  44.04 
 
 		 116 aa  90.5  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 		 389 aa  87.8  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  40.71 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.62 
 
 		 388 aa  85.9  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  38.39 
 
 		 323 aa  80.1  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  37.07 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  46.24 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.39 
 
 		 393 aa  74.7  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  32.03 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  41.84 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  41.84 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  35.59 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  39.42 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  43.75 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.76 
 
 		 478 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  37.76 
 
 		 484 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  33.66 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.76 
 
 		 478 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.76 
 
 		 478 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  37.76 
 
 		 484 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  33.61 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  36.05 
 
 		 470 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  33.66 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  37.76 
 
 		 478 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  32.77 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  37.14 
 
 		 361 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  33.87 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  38.79 
 
 		 438 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.68 
 
 		 478 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  33.65 
 
 		 480 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  43.53 
 
 		 119 aa  67  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  40.7 
 
 		 106 aa  67  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.24 
 
 		 480 aa  67  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  35.35 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  38.74 
 
 		 130 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  36.78 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  37.63 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  33.65 
 
 		 480 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  30.21 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  31.54 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  32.31 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  37.29 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  30.25 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  35.79 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  36.78 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  37.21 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  31.36 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  38.82 
 
 		 280 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  37.25 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  33.05 
 
 		 469 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  35.64 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01280  hypothetical protein  43.84 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000449614  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  37.21 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  43.82 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  32.32 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  32.79 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  32.76 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  34.75 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.07 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  39.33 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  36.14 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  38.75 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  40.74 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  31.45 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.19 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  34.21 
 
 		 141 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  38.1 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  35 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  37.17 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  38.55 
 
 		 459 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  38.55 
 
 		 459 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>