More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0124 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
159 aa  324  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  79.08 
 
 
161 aa  255  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  72.15 
 
 
158 aa  241  3.9999999999999997e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2325  Rhodanese domain protein  68.18 
 
 
155 aa  223  9e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0667353  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  63.4 
 
 
155 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  66.67 
 
 
157 aa  218  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  64.71 
 
 
157 aa  206  8e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  49.02 
 
 
153 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  45.26 
 
 
154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  39.13 
 
 
140 aa  98.2  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  37.4 
 
 
136 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  29.69 
 
 
137 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  36.29 
 
 
128 aa  84.7  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  36.29 
 
 
128 aa  84.7  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  36.3 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  35.77 
 
 
120 aa  73.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  32.48 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  34.88 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  34.17 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  41.86 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  32.38 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  32.06 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  32.52 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.01 
 
 
389 aa  64.7  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  26.23 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  29.06 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  34.58 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  32.74 
 
 
361 aa  63.9  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  33.7 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  40 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  25.41 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  31.93 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  31.53 
 
 
142 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.34 
 
 
393 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  31.45 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  34.21 
 
 
198 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  37.86 
 
 
354 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  32.76 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  36.19 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  34.69 
 
 
389 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  27.59 
 
 
123 aa  60.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.78 
 
 
392 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.68 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  34 
 
 
129 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  33.03 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  35.64 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  34.31 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  39.78 
 
 
189 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  29.06 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  35.85 
 
 
346 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  30.4 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  31.93 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  30.95 
 
 
192 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  35.05 
 
 
129 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.61 
 
 
395 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  35.79 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  39.25 
 
 
130 aa  58.2  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  33.03 
 
 
284 aa  58.2  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  29.17 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  35.79 
 
 
135 aa  58.2  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  34.65 
 
 
186 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 
123 aa  58.2  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  26.98 
 
 
189 aa  57.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  32.84 
 
 
199 aa  57.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  31.13 
 
 
121 aa  57.8  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  28.43 
 
 
167 aa  57.4  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 
103 aa  57.4  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  34.23 
 
 
113 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  34.69 
 
 
201 aa  57  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1123  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.78 
 
 
396 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  29.37 
 
 
225 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  30.89 
 
 
119 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0455  rhodanese domain-containing protein  28 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.98 
 
 
568 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  24.53 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  35.24 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  32.99 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.37 
 
 
388 aa  56.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  36.96 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.04 
 
 
390 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  30.16 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.71 
 
 
397 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.171411 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
472 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 
186 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  33.7 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 
184 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  33.33 
 
 
455 aa  55.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32 
 
 
395 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  31.36 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
225 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  29.91 
 
 
189 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1742  rhodanese-like domain-containing protein  38.04 
 
 
106 aa  55.1  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.112615  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 
221 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  29.66 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  32.09 
 
 
194 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 
221 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>