More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0032 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  100 
 
 
157 aa  320  4e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  61.69 
 
 
155 aa  212  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  64.71 
 
 
158 aa  209  7.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  64.71 
 
 
159 aa  206  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  61.94 
 
 
161 aa  200  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  63.33 
 
 
157 aa  194  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2325  Rhodanese domain protein  60.78 
 
 
155 aa  191  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0667353  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  54.25 
 
 
153 aa  166  9e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  49.28 
 
 
154 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  42.15 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  44.35 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  34.59 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  37.9 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  37.9 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  37.4 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  34.71 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  36.67 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  34.17 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  33.88 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  36.51 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  32.46 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  31.93 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.25 
 
 
399 aa  65.1  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.9 
 
 
393 aa  64.7  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  28.35 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  41.28 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  33.05 
 
 
361 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  35.85 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  40.45 
 
 
189 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  30.08 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  41.11 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  38.78 
 
 
136 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  34.71 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  33.61 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  32.8 
 
 
389 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  35.59 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  40.21 
 
 
116 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  39.53 
 
 
189 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
103 aa  61.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  35.79 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.65 
 
 
395 aa  60.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.3 
 
 
389 aa  60.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  35.35 
 
 
132 aa  60.8  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  37.21 
 
 
201 aa  60.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  29.06 
 
 
154 aa  60.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  26.67 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  32.09 
 
 
354 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
323 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  33.06 
 
 
346 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 
438 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  35.65 
 
 
377 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  25.83 
 
 
124 aa  58.9  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  31.2 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  31.86 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  31.2 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  31.2 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  31.2 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 
123 aa  58.2  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  34.21 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  37 
 
 
198 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  31.15 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.23 
 
 
395 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  30.43 
 
 
123 aa  58.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0296  Rhodanese domain protein  36.27 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  34.69 
 
 
129 aa  58.2  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  29.66 
 
 
159 aa  57.8  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  33.7 
 
 
135 aa  57.8  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  38.71 
 
 
170 aa  57.8  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
139 aa  57.8  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2923  Rhodanese domain protein  35.58 
 
 
99 aa  57.4  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.669081  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.47 
 
 
378 aa  57.4  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  34.17 
 
 
119 aa  57  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  36.08 
 
 
472 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.66 
 
 
390 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  30.68 
 
 
117 aa  57  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  31.58 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  37.65 
 
 
106 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2774  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.27 
 
 
399 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.165705  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  34.41 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  33.72 
 
 
186 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  35.42 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  28.83 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
189 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  36.63 
 
 
114 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.78 
 
 
397 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.171411 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 
113 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  31.67 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  30.4 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  37.5 
 
 
131 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
129 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  39.33 
 
 
220 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  26.4 
 
 
119 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  28.43 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  32.56 
 
 
186 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>