More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2325 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2325  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 155 aa  315  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0667353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  71.9 
 
 		 161 aa  234  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  68.63 
 
 		 155 aa  232  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  68.18 
 
 		 159 aa  223  8e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  67.74 
 
 		 158 aa  221  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  65.79 
 
 		 157 aa  210  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  60.78 
 
 		 157 aa  191  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  48.37 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  50.79 
 
 		 154 aa  97.1  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  38.66 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  33.07 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  37.61 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  36.51 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  33.61 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  34.19 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  37.74 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  32.09 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  36.28 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  30.7 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  39.13 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  26.23 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  26.23 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  26.67 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  40 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  32.67 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  32.79 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  33.63 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  30.33 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  29.91 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  37.78 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  31.93 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  31.93 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  31.93 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0887  rhodanese-like protein  41.3 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  31.93 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  34.65 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  29.51 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  30.43 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  32.79 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  29.79 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  30.83 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  31.09 
 
 		 119 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  31.09 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  33.67 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  32.28 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  28.7 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3354  aminotransferase, class V  32.38 
 
 		 759 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138183 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  33.7 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1506  cysteine desulfurase  33.98 
 
 		 753 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0838  aminotransferase, class V  32.67 
 
 		 778 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0677783  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  36.08 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  30 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  30.97 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  31.78 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  34.58 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  29.91 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.9 
 
 		 393 aa  54.3  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  30.51 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  34.38 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  33.02 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.67 
 
 		 562 aa  53.5  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  33.02 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  31.25 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  27.5 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  36.73 
 
 		 354 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  31.25 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  32.56 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0544  aminotransferase class V  32.35 
 
 		 761 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0566  aminotransferase class V  30.84 
 
 		 771 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  37.23 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  30.25 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  34.88 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  27.83 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  32.17 
 
 		 198 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  33.65 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  31.13 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 369 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2851  rhodanese domain-containing protein  30.56 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131553  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  27.27 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  30.3 
 
 		 197 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  26.23 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.71 
 
 		 550 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  32.61 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  29.52 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>