More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4038 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 125 aa  260  4e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  50 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  49.17 
 
 		 124 aa  137  6e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  57.85 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  53.04 
 
 		 119 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  53.98 
 
 		 119 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  52.07 
 
 		 119 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  49.18 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  47.5 
 
 		 123 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  46.67 
 
 		 123 aa  120  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  49.56 
 
 		 119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  49.56 
 
 		 119 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  49.56 
 
 		 119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  48.76 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  47.93 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  47.93 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  47.93 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  47.93 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  44.14 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  41.28 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.83 
 
 		 389 aa  96.3  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  37.61 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  41.44 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.02 
 
 		 393 aa  82  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  35.34 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  37.07 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  43.43 
 
 		 99 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.51 
 
 		 388 aa  79.3  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  39.47 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  36.28 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  39.32 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  38.4 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  36.44 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  42.42 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  35.45 
 
 		 346 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  32.82 
 
 		 354 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  34.71 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  35.35 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  37.29 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  32.41 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  36.07 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  34.15 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  33.07 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  34.86 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  33.07 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  35.29 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  29.75 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.78 
 
 		 380 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2325  Rhodanese domain protein  32.09 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0667353  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  31.93 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.78 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  32.84 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  36.44 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  32.52 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  34.13 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  32.06 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.07 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  37.08 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  35.43 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  35.16 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  34.58 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  34.71 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  29.06 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  34.52 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  33.06 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  34.17 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  32.11 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  35 
 
 		 470 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  32.79 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.08 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  31.93 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  35.24 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  35.24 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  41.38 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  33.05 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  34.29 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2086  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  36.94 
 
 		 438 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  34.13 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  41.98 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 		 527 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  33.67 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  34.15 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  31.97 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  34.15 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  34.45 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  41.98 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  32.03 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.37 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  36.96 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>