More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00096 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  100 
 
 		 132 aa  277  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  56.59 
 
 		 134 aa  156  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  43.44 
 
 		 126 aa  97.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  41.6 
 
 		 136 aa  95.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  44.92 
 
 		 133 aa  93.6  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  40.16 
 
 		 126 aa  92.8  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  40.98 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  38.71 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  34.96 
 
 		 361 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  45.05 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  33.87 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  32.06 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  38.1 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  36.29 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  36 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  36 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  36.59 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  33.96 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  34.91 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.65 
 
 		 389 aa  71.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  38.68 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.13 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  34.62 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  34.95 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  33.88 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  37.9 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  33.07 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  34.55 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  35.24 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  31.68 
 
 		 123 aa  67  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  33.87 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  38.6 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  33.07 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  32.84 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  30.65 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  31.75 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  32.5 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  31.58 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.04 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  36.21 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  32.5 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  33.06 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  35.25 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  34.96 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  30.89 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2325  Rhodanese domain protein  30.7 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0667353  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1238  hypothetical protein  29.51 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  29.84 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  36.73 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  29.75 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  32.74 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20151  molybdopterin biosynthesis protein  32.5 
 
 		 381 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.28602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  35.2 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  35.35 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  32.73 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  33.68 
 
 		 159 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  35.78 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  38.3 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  27.78 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  31 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  33.68 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  32.48 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  30.4 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  31.45 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  31.3 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2086  rhodanese-like protein  28.33 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  35.25 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  31.62 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  33.64 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05040  endoplasmic reticulum protein, putative  29.73 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.575301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  26.96 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  33.91 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  32.52 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  33.68 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  33.06 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  31.58 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  29.29 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  26.56 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  34.29 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  30.65 
 
 		 288 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1694  Rhodanese domain protein  33.66 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  34.95 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.11 
 
 		 393 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  31.62 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  29.57 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  35.14 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  35.96 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  31.96 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>