More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2086 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2086  rhodanese-like protein  100 
 
 		 121 aa  249  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1238  hypothetical protein  46.49 
 
 		 115 aa  115  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01280  hypothetical protein  47.27 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000449614  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  33.04 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.85 
 
 		 389 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  35 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  33.03 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  34.95 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  32.8 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  32.8 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  31.93 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  34.17 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  30.97 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  42.67 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  30.28 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40.85 
 
 		 388 aa  62.4  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  30.17 
 
 		 120 aa  62  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  30.09 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  41.33 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  29.41 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  32.52 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  30.91 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  36.9 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  39.47 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  34.02 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  40.85 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  37.74 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  29.41 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  34.02 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  28.33 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  33.93 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  34.02 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  34.02 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.58 
 
 		 393 aa  57.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  31.3 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  36.08 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  34.67 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  32.1 
 
 		 163 aa  57  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  34.83 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  39.47 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  31.25 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.26 
 
 		 386 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  32.97 
 
 		 470 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  28.57 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.74 
 
 		 390 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  32.43 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  33.71 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  31.71 
 
 		 323 aa  54.7  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  32 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  30.91 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  27.5 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.78 
 
 		 380 aa  53.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  28.45 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  37.66 
 
 		 280 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  33.71 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.04 
 
 		 480 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  31.17 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  32.29 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  35.29 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.16 
 
 		 566 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.16 
 
 		 566 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  44.29 
 
 		 398 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  25.83 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  33.7 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  34.21 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  30.38 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  28.33 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1646  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  35.38 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604972 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  30.59 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1810  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  35.38 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000312161 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1811  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  35.38 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1872  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  35.38 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0100112 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1464  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  35.38 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176791  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  37.65 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01296  hypothetical protein  34.21 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1518  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  34.21 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>