More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1518 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01285  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  100 
 
 		 104 aa  216  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2338  phage shock operon rhodanese PspE  100 
 
 		 104 aa  216  7.999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00488281  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1544  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  100 
 
 		 104 aa  216  7.999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2317  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  100 
 
 		 104 aa  216  7.999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00657888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1518  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  100 
 
 		 104 aa  216  7.999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1814  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  100 
 
 		 104 aa  216  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.309116 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1423  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  100 
 
 		 104 aa  216  7.999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01296  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  216  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  99.04 
 
 		 104 aa  214  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1646  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  66.99 
 
 		 104 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1811  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  66.99 
 
 		 104 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1464  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  66.99 
 
 		 104 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176791  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1810  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  66.02 
 
 		 104 aa  160  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000312161 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1872  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  66.67 
 
 		 103 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0100112 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  45.68 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  47.89 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  35.45 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  44.16 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  33.88 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0063  Rhodanese domain protein  43.28 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0402698 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  46.58 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  38.67 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  37.84 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  39.44 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  42.67 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  35.19 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  36.49 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  37.31 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  40.54 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  34.62 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  38.36 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.75 
 
 		 568 aa  63.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  38.67 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  39.19 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  39.19 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 131 aa  62  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  38.67 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  42.47 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  38.67 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  38.67 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  41.89 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  35.71 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  39.19 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  36.62 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  30.65 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  43.28 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  40.54 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  44.78 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  32.95 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  35.44 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  37.93 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  39.44 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0873  rhodanese-like domain protein  37.84 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000378208 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0689  rhodanese-like domain-containing protein  37.84 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.152263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0675  rhodanese-like domain-containing protein  37.84 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.852423  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  37.84 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  36.11 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  37.68 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  34.29 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0741  rhodanese-like domain-containing protein  37.84 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.138504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0779  rhodanese-like domain-containing protein  37.84 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2946  cyclic nucleotide-binding protein  34.15 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360561  normal  0.390891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  35.82 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  36.92 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  40.3 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  32.47 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  46.27 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2943  rhodanese domain-containing protein  34.67 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22665  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0839  rhodanese-like domain-containing protein  36.76 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0930  hypothetical protein  38.67 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0119442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  40.28 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 		 389 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0689  rhodanese domain-containing protein  36.49 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  41.79 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  36.49 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  42.25 
 
 		 220 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.04 
 
 		 813 aa  54.3  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0541  hypothetical protein  38.57 
 
 		 598 aa  54.3  0.0000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.360191  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  34.48 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  38.03 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  35.21 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  42.11 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4503  rhodanese-like domain protein  36.49 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000135209 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  36.92 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  42.47 
 
 		 277 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  36.07 
 
 		 271 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  35.8 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  38.57 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  36.49 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>