More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16580 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  100 
 
 
106 aa  214  5e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  51.9 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  41.46 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  40.7 
 
 
119 aa  67  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  41.46 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  41.46 
 
 
119 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  43.24 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  41.98 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  43.18 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  44.44 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  45.45 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  40.74 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  39.51 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 
117 aa  62.8  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  37.97 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  45.95 
 
 
388 aa  62.4  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  39.51 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  34.02 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  40.23 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1464  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  40.28 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176791  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  37.66 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1646  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  40.28 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1811  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  40.28 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  46.07 
 
 
116 aa  60.8  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1872  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  40.28 
 
 
103 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0100112 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  39.08 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  39.76 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  38.16 
 
 
109 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  41.77 
 
 
144 aa  60.1  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 
167 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  36.26 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1810  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  38.89 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000312161 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  40.79 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  36.26 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  35.63 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  36.05 
 
 
229 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  39.02 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  34 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  40.51 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 
186 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  37.8 
 
 
186 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  37.8 
 
 
186 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  38.27 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 
186 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  34.94 
 
 
186 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  37.8 
 
 
186 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  38.96 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  32 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  34.94 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  38.96 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  33.77 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  36.49 
 
 
116 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  38.27 
 
 
361 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  34.48 
 
 
135 aa  57.8  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  39.51 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  37.93 
 
 
138 aa  57.8  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.71 
 
 
189 aa  57  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0063  Rhodanese domain protein  38.57 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0402698 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.14 
 
 
163 aa  57.4  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  35.37 
 
 
186 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  35.06 
 
 
123 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  35.42 
 
 
103 aa  57  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  38.36 
 
 
128 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.03 
 
 
389 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  35.37 
 
 
186 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.51 
 
 
393 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  34.88 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  36.14 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  35 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01285  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  32.47 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2338  phage shock operon rhodanese PspE  32.47 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00488281  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  35.64 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3482  rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  37.5 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0088  rhodanese domain-containing protein  35.53 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00487418 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1544  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  32.47 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  37.84 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1814  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  32.47 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.309116 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1518  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  32.47 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2317  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  32.47 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00657888  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1423  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  32.47 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  43.02 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  34.18 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01296  hypothetical protein  32.47 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  36.49 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  33.01 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  32.53 
 
 
194 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  31.58 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  36.84 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  34.74 
 
 
480 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>